我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
我想找到有“abc”和“efg”的文件,这两个字符串在该文件中的不同行。一个包含以下内容的文件:
blah blah..
blah blah..
blah abc blah
blah blah..
blah blah..
blah blah..
blah efg blah blah
blah blah..
blah blah..
应该匹配。
当前回答
如果你对你要找的两个字符串'abc'和'efg'之间的距离有一些估计,你可以使用:
grep -r . -e 'abc' -A num1 -B num2 | grep 'efg'
这样,第一个grep将返回'abc' + #num1行,后面是#num2行,第二个grep将筛选所有这些以获得'efg'。 然后您将知道它们同时出现在哪些文件中。
其他回答
这可以通过首先使用tr用其他字符替换换行符来轻松完成:
tr '\n' '\a' | grep -o 'abc.*def' | tr '\a' '\n'
这里,我使用警报字符\a (ASCII 7)来代替换行符。 这在你的文本中几乎找不到,而且grep可以用一个.匹配它,或者专门用\a匹配它。
这个也能用吗?!
perl -lpne 'print $ARGV if /abc.*?efg/s' file_list
$ARGV包含从file_list读取当前文件时的文件名 /s修饰符跨换行搜索。
用银搜索器:
ag 'abc.*(\n|.)*efg' your_filename
与戒指持有者的答案相似,但用ag代替。银色搜索者的速度优势可能在这里大放异彩。
我用它从一个multi fasta文件中提取一个fasta序列,使用grep的-P选项:
grep -Pzo ">tig00000034[^>]+" file.fasta > desired_sequence.fasta
基于perl的搜索 Z表示行以0字节结尾,而不是换行字符 O来捕获匹配的内容,因为grep返回整行(在本例中,因为您做了-z是整个文件)。
regexp的核心是[^>],它翻译为“不大于符号”。
如果可以使用Perl,就可以很容易地做到这一点。
perl -ne 'if (/abc/) { $abc = 1; next }; print "Found in $ARGV\n" if ($abc && /efg/); }' yourfilename.txt
您也可以使用单个正则表达式来实现这一点,但这涉及到将文件的整个内容放入单个字符串中,对于大型文件,这可能会占用太多内存。 为了完整起见,下面是该方法:
perl -e '@lines = <>; $content = join("", @lines); print "Found in $ARGV\n" if ($content =~ /abc.*efg/s);' yourfilename.txt