我有一个嵌套的数据列表。它的长度是132,每一项是一个长度为20的列表。是否有一种快速的方法可以将这种结构转换为具有132行和20列数据的数据帧?

下面是一些示例数据:

l <- replicate(
  132,
  as.list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

当前回答

尝试折叠::unlist2d ('unlist to data.frame'的简写):

l <- replicate(
  132,
  list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

library(collapse)
head(unlist2d(l))
  .id.1 .id.2 V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
1     1     1  e  x  b  d  s  p  a  c  k   z   q   m   u   l   h   n   r   t   o   y
2     2     1  r  t  i  k  m  b  h  n  s   e   p   f   o   c   x   l   g   v   a   j
3     3     1  t  r  v  z  a  u  c  o  w   f   m   b   d   g   p   q   y   e   n   k
4     4     1  x  i  e  p  f  d  q  k  h   b   j   s   z   a   t   v   y   l   m   n
5     5     1  d  z  k  y  a  p  b  h  c   v   f   m   u   l   n   q   e   i   w   j
6     6     1  l  f  s  u  o  v  p  z  q   e   r   c   h   n   a   t   m   k   y   x

head(unlist2d(l, idcols = FALSE))
  V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
1  e  x  b  d  s  p  a  c  k   z   q   m   u   l   h   n   r   t   o   y
2  r  t  i  k  m  b  h  n  s   e   p   f   o   c   x   l   g   v   a   j
3  t  r  v  z  a  u  c  o  w   f   m   b   d   g   p   q   y   e   n   k
4  x  i  e  p  f  d  q  k  h   b   j   s   z   a   t   v   y   l   m   n
5  d  z  k  y  a  p  b  h  c   v   f   m   u   l   n   q   e   i   w   j
6  l  f  s  u  o  v  p  z  q   e   r   c   h   n   a   t   m   k   y   x

其他回答

对于使用purrr系列解决方案的并行(多核,多会话等)解决方案,使用:

library (furrr)
plan(multisession) # see below to see which other plan() is the more efficient
myTibble <- future_map_dfc(l, ~.x)

其中l是列表。

要对最有效的计划()进行基准测试,您可以使用:

library(tictoc)
plan(sequential) # reference time
# plan(multisession) # benchamark plan() goes here. See ?plan().
tic()
myTibble <- future_map_dfc(l, ~.x)
toc()

修正样本数据,使其符合原始描述“每个项目是一个长度为20的列表”

mylistlist <- replicate(
  132,
  as.list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

我们可以像这样把它转换成一个数据帧:

data.frame(t(sapply(mylistlist,c)))

Sapply将其转换为矩阵。 data.frame将矩阵转换为数据帧。

导致:

如果您的列表具有相同尺寸的元素,则可以使用来自tidyverse的bind_rows函数。

# Load the tidyverse
Library(tidyverse)

# make a list with elements having same dimensions
My_list <- list(a = c(1, 4, 5), b = c(9, 3, 8))

## Bind the rows
My_list %>% bind_rows()

结果是一个有两行的数据帧。

对于像从嵌套JSON中获得的3级或更多级别的深度嵌套列表的一般情况:

{
"2015": {
  "spain": {"population": 43, "GNP": 9},
  "sweden": {"population": 7, "GNP": 6}},
"2016": {
  "spain": {"population": 45, "GNP": 10},
  "sweden": {"population": 9, "GNP": 8}}
}

考虑一下melt()将嵌套列表转换为高格式的方法:

myjson <- jsonlite:fromJSON(file("test.json"))
tall <- reshape2::melt(myjson)[, c("L1", "L2", "L3", "value")]
    L1     L2         L3 value
1 2015  spain population    43
2 2015  spain        GNP     9
3 2015 sweden population     7
4 2015 sweden        GNP     6
5 2016  spain population    45
6 2016  spain        GNP    10
7 2016 sweden population     9
8 2016 sweden        GNP     8

接着是dcast(),然后再次扩大到一个整洁的数据集,其中每个变量组成一个a列,每个观察值组成一行:

wide <- reshape2::dcast(tall, L1+L2~L3) 
# left side of the formula defines the rows/observations and the 
# right side defines the variables/measurements
    L1     L2 GNP population
1 2015  spain   9         43
2 2015 sweden   6          7
3 2016  spain  10         45
4 2016 sweden   8          9

用rbind

do.call(rbind.data.frame, your_list)

编辑:以前的版本返回list的data.frame而不是向量(正如@IanSudbery在评论中指出的那样)。