我试图使用熊猫操作.csv文件,但我得到这个错误:
pandas.parser.CParserError:标记数据错误。C错误:第3行有2个字段,见12
我试着读过熊猫的文件,但一无所获。
我的代码很简单:
path = 'GOOG Key Ratios.csv'
#print(open(path).read())
data = pd.read_csv(path)
我该如何解决这个问题?我应该使用csv模块还是其他语言?
文件来自晨星公司
我试图使用熊猫操作.csv文件,但我得到这个错误:
pandas.parser.CParserError:标记数据错误。C错误:第3行有2个字段,见12
我试着读过熊猫的文件,但一无所获。
我的代码很简单:
path = 'GOOG Key Ratios.csv'
#print(open(path).read())
data = pd.read_csv(path)
我该如何解决这个问题?我应该使用csv模块还是其他语言?
文件来自晨星公司
当前回答
这可能是个问题
数据中的分隔符 第一行,正如@TomAugspurger所指出的
要解决这个问题,请在调用read_csv时尝试指定sep和/或头参数。例如,
df = pandas.read_csv(filepath, sep='delimiter', header=None)
在上面的代码中,sep定义了您的分隔符和header=None,告诉pandas您的源数据没有作为标题/列标题的行。因此,文档说:“如果文件不包含标题行,那么你应该显式地传递header=None”。在这种情况下,pandas会自动为每个字段{0,1,2,…}创建整数索引。
根据文档,分隔符应该不是问题。文档中说“如果sep为None[未指定],将尝试自动确定此值。”然而,我在这方面运气不太好,包括带有明显分隔符的实例。
另一种解决方案可能是尝试自动检测分隔符
# use the first 2 lines of the file to detect separator
temp_lines = csv_file.readline() + '\n' + csv_file.readline()
dialect = csv.Sniffer().sniff(temp_lines, delimiters=';,')
# remember to go back to the start of the file for the next time it's read
csv_file.seek(0)
df = pd.read_csv(csv_file, sep=dialect.delimiter)
其他回答
我也遇到过同样的问题。在同一个源文件上使用pd.read_table()似乎可以工作。我找不到原因,但对我的情况来说,这是一个有用的变通办法。也许有更博学的人能解释清楚为什么它能起作用。
编辑: 我发现,当文件中的某些文本与实际数据的格式不一致时,这个错误就会出现。这通常是页眉或页脚信息(大于一行,所以skip_header不起作用),它们不会被与实际数据相同数量的逗号分隔(当使用read_csv时)。使用read_table使用制表符作为分隔符,可以避免用户当前错误,但引入其他错误。
我通常通过将额外的数据读入文件,然后使用read_csv()方法来解决这个问题。
具体的解决方案可能因您的实际文件而异,但这种方法在一些情况下对我来说是有效的
你可以使用:
pd.read_csv("mycsv.csv", delimiter=";")
熊猫1.4.4
它可以是文件的分隔符,将其作为文本文件打开,查找分隔符。然后,您将拥有可以为空且未命名的列,因为行包含太多分隔符。
因此,您可以使用pandas来处理它们并检查值。对我来说,这比在我的情况下跳过台词要好。
对于那些在linux操作系统上使用Python 3有类似问题的人。
pandas.errors.ParserError: Error tokenizing data. C error: Calling
read(nbytes) on source failed. Try engine='python'.
试一试:
df.read_csv('file.csv', encoding='utf8', engine='python')
在我的例子中,这是因为csv文件的第一行和最后两行格式与文件的中间内容不同。
因此,我所做的是将csv文件作为字符串打开,解析字符串的内容,然后使用read_csv获取数据帧。
import io
import pandas as pd
file = open(f'{file_path}/{file_name}', 'r')
content = file.read()
# change new line character from '\r\n' to '\n'
lines = content.replace('\r', '').split('\n')
# Remove the first and last 2 lines of the file
# StringIO can be considered as a file stored in memory
df = pd.read_csv(StringIO("\n".join(lines[2:-2])), header=None)
我遇到过这样的错误,一个丢失的引号。我使用映射软件,当导出以逗号分隔的文件时,它会在文本项周围加上引号。使用引号的文本(例如:' =英尺和' =英寸)可能会导致分隔符冲突。考虑下面这个例子,5英寸的测井曲线打印很差:
UWI_key,经度,纬度,备注 US42051316890000, 30.4386484, -96.4330734,“可怜的5””
用5英寸作为5英寸的简写,最终会给工作带来麻烦。Excel会简单地去掉额外的引号,但是Pandas没有上面提到的error_bad_lines=False参数就会失效。