我试图使用熊猫操作.csv文件,但我得到这个错误:

pandas.parser.CParserError:标记数据错误。C错误:第3行有2个字段,见12

我试着读过熊猫的文件,但一无所获。

我的代码很简单:

path = 'GOOG Key Ratios.csv'
#print(open(path).read())
data = pd.read_csv(path)

我该如何解决这个问题?我应该使用csv模块还是其他语言?

文件来自晨星公司


当前回答

我从同事那里收到了.csv文件,当我试图使用pd.read_csv()读取csv文件时,我收到了类似的错误。显然,它试图使用第一行来为数据框架生成列,但许多行包含的列比第一行所暗示的要多。我最终通过简单地打开文件并重新保存为.csv并再次使用pd.read_csv()来解决这个问题。

其他回答

我有同样的问题,当read_csv: ParserError:错误标记数据。 我只是把旧的csv文件保存为一个新的csv文件。问题解决了!

我也有这个问题,但可能是出于不同的原因。我在我的CSV中有一些尾随逗号,添加了熊猫试图读取的额外列。使用以下方法是可行的,但它只是忽略了不好的行:

data = pd.read_csv('file1.csv', error_bad_lines=False)

如果你想让代码行看起来很丑,你可以这样做:

line     = []
expected = []
saw      = []     
cont     = True 

while cont == True:     
    try:
        data = pd.read_csv('file1.csv',skiprows=line)
        cont = False
    except Exception as e:    
        errortype = e.message.split('.')[0].strip()                                
        if errortype == 'Error tokenizing data':                        
           cerror      = e.message.split(':')[1].strip().replace(',','')
           nums        = [n for n in cerror.split(' ') if str.isdigit(n)]
           expected.append(int(nums[0]))
           saw.append(int(nums[2]))
           line.append(int(nums[1])-1)
         else:
           cerror      = 'Unknown'
           print 'Unknown Error - 222'

if line != []:
    # Handle the errors however you want

我接着写了一个脚本,将这些行重新插入到DataFrame中,因为坏的行将由上述代码中的变量“line”给出。这一切都可以通过简单地使用csv阅读器来避免。希望熊猫的开发人员能够在未来更容易地处理这种情况。

这看起来很丑,但你会有你的数据框架

import re
path = 'GOOG Key Ratios.csv'

try:
    data = pd.read_csv(path)
except Exception as e:
    val = re.findall('tokenizing.{1,100}\s*Expected\s*(\d{1,2})\s*',str(e),re.I)
    data = pd.read_csv(path, skiprows=int(val[0])-1)

在我的例子中,这是因为csv文件的第一行和最后两行格式与文件的中间内容不同。

因此,我所做的是将csv文件作为字符串打开,解析字符串的内容,然后使用read_csv获取数据帧。

import io
import pandas as pd

file = open(f'{file_path}/{file_name}', 'r')
content = file.read()

# change new line character from '\r\n' to '\n'
lines = content.replace('\r', '').split('\n')

# Remove the first and last 2 lines of the file
# StringIO can be considered as a file stored in memory
df = pd.read_csv(StringIO("\n".join(lines[2:-2])), header=None)

我自己也遇到过几次这样的问题。几乎每次,原因都是我试图打开的文件一开始就不是一个正确保存的CSV。这里的“适当”是指每一行都有相同数量的分隔符或列。

通常发生这种情况是因为我在Excel中打开了CSV,然后不恰当地保存了它。尽管文件扩展名仍然是. CSV,但纯CSV格式已经被改变了。

任何以pandas to_csv保存的文件都将被正确格式化,不应该有这个问题。但如果你用另一个程序打开它,它可能会改变结构。

希望这能有所帮助。