对我来说，这很有帮助: 更新您的主目录“标记目录为”->“源根”

天哪，这是一个噩梦，我的不同的StackOVerflow答案的合并:

切换到本地解释器/usr/bin/pythonX.X和应用 像上面那样查看路径 找到骷髅的路径。我的是(/home/tim/Desktop/pycharm-community-2016.2.3/helpers/python-skeleton) 切换回virt解释器，并手动添加骷髅路径，如果它没有自动显示。

我有一个项目，其中一个文件在src/导入另一个文件在同一目录。要让PyCharm识别，我必须去文件>设置>项目>项目结构>选择src文件夹，然后点击“标记为:源”

从https://www.jetbrains.com/help/pycharm/configuring-folders-within-a-content-root.html

源根包含实际的源文件和资源。PyCharm使用源根作为解析导入的起点

文件|无效缓存…重新启动PyCharm会有所帮助。

再补充一个:涉及Python解释器选项卡的解决方案都没有帮助，然而，我注意到我必须设置项目依赖项:在有未解决的引用错误的项目中，没有任何依赖项被检查。一旦我检查了，相关的错误就消失了。我不知道为什么一开始就检查了一些，而另一些没有。

也可能是python版本问题。我得选对人，才行。