我试着用R来计算矩阵中一系列值的移动平均值。R中似乎没有一个内置函数可以让我计算移动平均线。有任何软件包提供这样的服务吗?还是需要我自己写?
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动物园包中的滚动平均值/最大值/中位数(rollmean) TTR中的移动平均线 马云在预测
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为了配合坎迪奇西斯和罗德里戈·雷麦黛奥的回答;
moving_fun <- function(x, w, FUN, ...) {
# x: a double vector
# w: the length of the window, i.e., the section of the vector selected to apply FUN
# FUN: a function that takes a vector and return a summarize value, e.g., mean, sum, etc.
# Given a double type vector apply a FUN over a moving window from left to the right,
# when a window boundary is not a legal section, i.e. lower_bound and i (upper bound)
# are not contained in the length of the vector, return a NA_real_
if (w < 1) {
stop("The length of the window 'w' must be greater than 0")
}
output <- x
for (i in 1:length(x)) {
# plus 1 because the index is inclusive with the upper_bound 'i'
lower_bound <- i - w + 1
if (lower_bound < 1) {
output[i] <- NA_real_
} else {
output[i] <- FUN(x[lower_bound:i, ...])
}
}
output
}
# example
v <- seq(1:10)
# compute a MA(2)
moving_fun(v, 2, mean)
# compute moving sum of two periods
moving_fun(v, 2, sum)
虽然有点慢,但你也可以使用zoo::rollapply在矩阵上执行计算。
reqd_ma <- rollapply(x, FUN = mean, width = n)
其中x为数据集,FUN = mean为函数;你也可以改变它为min, max, sd等,宽度是滚动窗口。
可以使用runner包来移动函数。在本例中是mean_run函数。cummean的问题是它不处理NA值,但mean_run可以。Runner包还支持不规则时间序列,Windows可以依赖于日期:
library(runner)
set.seed(11)
x1 <- rnorm(15)
x2 <- sample(c(rep(NA,5), rnorm(15)), 15, replace = TRUE)
date <- Sys.Date() + cumsum(sample(1:3, 15, replace = TRUE))
mean_run(x1)
#> [1] -0.5910311 -0.2822184 -0.6936633 -0.8609108 -0.4530308 -0.5332176
#> [7] -0.2679571 -0.1563477 -0.1440561 -0.2300625 -0.2844599 -0.2897842
#> [13] -0.3858234 -0.3765192 -0.4280809
mean_run(x2, na_rm = TRUE)
#> [1] -0.18760011 -0.09022066 -0.06543317 0.03906450 -0.12188853 -0.13873536
#> [7] -0.13873536 -0.14571604 -0.12596067 -0.11116961 -0.09881996 -0.08871569
#> [13] -0.05194292 -0.04699909 -0.05704202
mean_run(x2, na_rm = FALSE )
#> [1] -0.18760011 -0.09022066 -0.06543317 0.03906450 -0.12188853 -0.13873536
#> [7] NA NA NA NA NA NA
#> [13] NA NA NA
mean_run(x2, na_rm = TRUE, k = 4)
#> [1] -0.18760011 -0.09022066 -0.06543317 0.03906450 -0.10546063 -0.16299272
#> [7] -0.21203756 -0.39209010 -0.13274756 -0.05603811 -0.03894684 0.01103493
#> [13] 0.09609256 0.09738460 0.04740283
mean_run(x2, na_rm = TRUE, k = 4, idx = date)
#> [1] -0.187600111 -0.090220655 -0.004349696 0.168349653 -0.206571573 -0.494335093
#> [7] -0.222969541 -0.187600111 -0.087636571 0.009742884 0.009742884 0.012326968
#> [13] 0.182442234 0.125737145 0.059094786
还可以指定其他选项,如延迟和仅在特定索引处滚动。更多内容在包和函数文档中。
或者你可以简单地计算它使用过滤器,这是我使用的函数:
ma <- function(x, n = 5){filter(x, rep(1 / n, n), sides = 2)}
如果使用dplyr,请注意在上面的函数中指定stats::filter。
使用费用应充分、有效。假设你有一个向量x,你想要n个数的和
cx <- c(0,cumsum(x))
rsum <- (cx[(n+1):length(cx)] - cx[1:(length(cx) - n)]) / n
正如@mzuther在评论中指出的那样,这假设数据中没有NAs。要处理这些问题,需要将每个窗口除以非na值的数量。这里有一种方法,结合@里卡多·克鲁兹的评论:
cx <- c(0, cumsum(ifelse(is.na(x), 0, x)))
cn <- c(0, cumsum(ifelse(is.na(x), 0, 1)))
rx <- cx[(n+1):length(cx)] - cx[1:(length(cx) - n)]
rn <- cn[(n+1):length(cx)] - cn[1:(length(cx) - n)]
rsum <- rx / rn
这仍然有一个问题,如果窗口中的所有值都是NAs,那么将会有一个零误差的除法。