我试着用R来计算矩阵中一系列值的移动平均值。R中似乎没有一个内置函数可以让我计算移动平均线。有任何软件包提供这样的服务吗?还是需要我自己写?
当前回答
vector_avg <- function(x){
sum_x = 0
for(i in 1:length(x)){
if(!is.na(x[i]))
sum_x = sum_x + x[i]
}
return(sum_x/length(x))
}
其他回答
事实上,RcppRoll非常好。
cantdutchthis发布的代码必须在窗口的第四行进行修正:
ma <- function(arr, n=15){
res = arr
for(i in n:length(arr)){
res[i] = mean(arr[(i-n+1):i])
}
res
}
这里给出了另一种处理缺失的方法。
第三种方法,改进cantdutch这段代码来计算部分平均与否,如下:
ma <- function(x, n=2,parcial=TRUE){
res = x #set the first values
if (parcial==TRUE){
for(i in 1:length(x)){
t<-max(i-n+1,1)
res[i] = mean(x[t:i])
}
res
}else{
for(i in 1:length(x)){
t<-max(i-n+1,1)
res[i] = mean(x[t:i])
}
res[-c(seq(1,n-1,1))] #remove the n-1 first,i.e., res[c(-3,-4,...)]
}
}
下面是一个简单的带有过滤器的函数,演示了一种方法来处理带有填充的开始和结束NAs,并使用自定义权重计算加权平均值(由过滤器支持):
wma <- function(x) {
wts <- c(seq(0.5, 4, 0.5), seq(3.5, 0.5, -0.5))
nside <- (length(wts)-1)/2
# pad x with begin and end values for filter to avoid NAs
xp <- c(rep(first(x), nside), x, rep(last(x), nside))
z <- stats::filter(xp, wts/sum(wts), sides = 2) %>% as.vector
z[(nside+1):(nside+length(x))]
}
使用费用应充分、有效。假设你有一个向量x,你想要n个数的和
cx <- c(0,cumsum(x))
rsum <- (cx[(n+1):length(cx)] - cx[1:(length(cx) - n)]) / n
正如@mzuther在评论中指出的那样,这假设数据中没有NAs。要处理这些问题,需要将每个窗口除以非na值的数量。这里有一种方法,结合@里卡多·克鲁兹的评论:
cx <- c(0, cumsum(ifelse(is.na(x), 0, x)))
cn <- c(0, cumsum(ifelse(is.na(x), 0, 1)))
rx <- cx[(n+1):length(cx)] - cx[1:(length(cx) - n)]
rn <- cn[(n+1):length(cx)] - cn[1:(length(cx) - n)]
rsum <- rx / rn
这仍然有一个问题,如果窗口中的所有值都是NAs,那么将会有一个零误差的除法。
在数据。表1.12.0增加了新的滚动平均值函数,以计算快速和准确的滚动平均值,仔细处理NA, NaN和+Inf, -Inf值。
由于在这个问题中没有可重复的例子,所以在这里没有更多的问题要解决。
你可以在手册中找到更多关于?frollmean的信息,也可以在?frollmean网站上找到。
下面是手册中的例子:
library(data.table)
d = as.data.table(list(1:6/2, 3:8/4))
# rollmean of single vector and single window
frollmean(d[, V1], 3)
# multiple columns at once
frollmean(d, 3)
# multiple windows at once
frollmean(d[, .(V1)], c(3, 4))
# multiple columns and multiple windows at once
frollmean(d, c(3, 4))
## three above are embarrassingly parallel using openmp
下面的示例代码展示了如何使用zoo包中的rollmean函数计算居中移动平均和尾随移动平均。
library(tidyverse)
library(zoo)
some_data = tibble(day = 1:10)
# cma = centered moving average
# tma = trailing moving average
some_data = some_data %>%
mutate(cma = rollmean(day, k = 3, fill = NA)) %>%
mutate(tma = rollmean(day, k = 3, fill = NA, align = "right"))
some_data
#> # A tibble: 10 x 3
#> day cma tma
#> <int> <dbl> <dbl>
#> 1 1 NA NA
#> 2 2 2 NA
#> 3 3 3 2
#> 4 4 4 3
#> 5 5 5 4
#> 6 6 6 5
#> 7 7 7 6
#> 8 8 8 7
#> 9 9 9 8
#> 10 10 NA 9
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