一般来说,有没有一种有效的方法可以知道Python中的迭代器中有多少个元素,而不用遍历每个元素并计数?


当前回答

一个简单的基准:

import collections
import itertools

def count_iter_items(iterable):
    counter = itertools.count()
    collections.deque(itertools.izip(iterable, counter), maxlen=0)
    return next(counter)

def count_lencheck(iterable):
    if hasattr(iterable, '__len__'):
        return len(iterable)

    d = collections.deque(enumerate(iterable, 1), maxlen=1)
    return d[0][0] if d else 0

def count_sum(iterable):           
    return sum(1 for _ in iterable)

iter = lambda y: (x for x in xrange(y))

%timeit count_iter_items(iter(1000))
%timeit count_lencheck(iter(1000))
%timeit count_sum(iter(1000))

结果:

10000 loops, best of 3: 37.2 µs per loop
10000 loops, best of 3: 47.6 µs per loop
10000 loops, best of 3: 61 µs per loop

例如,简单的count_iter_items是可行的方法。

为python3调整:

61.9 µs ± 275 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
74.4 µs ± 190 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)
82.6 µs ± 164 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10000 loops each)

其他回答

通常的做法是将这类信息放在文件头中,并让pysam允许您访问这些信息。我不知道格式,但是你检查过API了吗?

正如其他人所说,你不能从迭代器中知道长度。

一个简单的方法是使用内置函数set()或list():

答:set()在迭代器中没有重复项的情况下(最快的方式)

iter = zip([1,2,3],['a','b','c'])
print(len(set(iter)) # set(iter) = {(1, 'a'), (2, 'b'), (3, 'c')}
Out[45]: 3

or

iter = range(1,10)
print(len(set(iter)) # set(iter) = {1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9}
Out[47]: 9

B: list()以防迭代器中有重复的项

iter = (1,2,1,2,1,2,1,2)
print(len(list(iter)) # list(iter) = [1, 2, 1, 2, 1, 2, 1, 2]
Out[49]: 8
# compare with set function
print(len(set(iter)) # set(iter) = {1, 2}
Out[51]: 2

迭代器只是一个对象,它有一个指向下一个对象的指针,由某种缓冲区或流读取,它就像一个LinkedList,在那里你不知道你有多少东西,直到你遍历它们。迭代器是高效的,因为它们所做的一切都是通过引用而不是使用索引告诉你下一个是什么(但是正如你所看到的,你失去了查看下一个条目有多少的能力)。

不能(除非特定迭代器的类型实现了一些特定的方法,使之成为可能)。

通常,只能通过使用迭代器来计数迭代器项。最有效的方法之一:

import itertools
from collections import deque

def count_iter_items(iterable):
    """
    Consume an iterable not reading it into memory; return the number of items.
    """
    counter = itertools.count()
    deque(itertools.izip(iterable, counter), maxlen=0)  # (consume at C speed)
    return next(counter)

(对于Python 3。X替换itertools。Izip with zip)。

在计算机上有两种方法来获取“某物”的长度。

第一种方法是存储一个计数——这需要任何接触文件/数据的东西来修改它(或者一个只公开接口的类——但归根结底是一样的)。

另一种方法是遍历它并计算它有多大。