在摆弄了@journois的答案后，由于Panel的弃用，我能够使用MultiIndex而不是Panel来工作。

首先，创建一些虚拟数据:

df1 = pd.DataFrame({
    'id': ['111', '222', '333', '444', '555'],
    'let': ['a', 'b', 'c', 'd', 'e'],
    'num': ['1', '2', '3', '4', '5']
})
df2 = pd.DataFrame({
    'id': ['111', '222', '333', '444', '666'],
    'let': ['a', 'b', 'c', 'D', 'f'],
    'num': ['1', '2', 'Three', '4', '6'],
})

然后，定义你的diff函数，在这种情况下，我将使用他的答案report_diff保持不变:

def report_diff(x):
    return x[0] if x[0] == x[1] else '{} | {}'.format(*x)

然后，我将数据连接到一个MultiIndex数据框架:

df_all = pd.concat(
    [df1.set_index('id'), df2.set_index('id')], 
    axis='columns', 
    keys=['df1', 'df2'],
    join='outer'
)
df_all = df_all.swaplevel(axis='columns')[df1.columns[1:]]

最后，我将对每个列组应用report_diff:

df_final.groupby(level=0, axis=1).apply(lambda frame: frame.apply(report_diff, axis=1))

这个输出:

         let        num
111        a          1
222        b          2
333        c  3 | Three
444    d | D          4
555  e | nan    5 | nan
666  nan | f    nan | 6

这就是全部!

如果您发现这个线程试图在测试中比较数据名称，那么请查看assert_frame_equal方法:https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.testing.assert_frame_equal.html

扩展@cge的答案，这对于结果的可读性来说非常酷:

a[a != b][np.any(a != b, axis=1)].join(pd.DataFrame('a<->b', index=a.index, columns=['a<=>b'])).join(
        b[a != b][np.any(a != b, axis=1)]
        ,rsuffix='_b', how='outer'
).fillna('')

完整的演示示例:

import numpy as np, pandas as pd

a = pd.DataFrame(np.random.randn(7,3), columns=list('ABC'))
b = a.copy()
b.iloc[0,2] = np.nan
b.iloc[1,0] = 7
b.iloc[3,1] = 77
b.iloc[4,2] = 777

a[a != b][np.any(a != b, axis=1)].join(pd.DataFrame('a<->b', index=a.index, columns=['a<=>b'])).join(
        b[a != b][np.any(a != b, axis=1)]
        ,rsuffix='_b', how='outer'
).fillna('')

结果:样本

在线演示

突出显示两个数据框架之间的差异

可以使用DataFrame样式属性来突出显示有差异的单元格的背景颜色。

使用原始问题中的示例数据

第一步是用concat函数水平连接dataframe，并用keys参数区分每一帧:

df_all = pd.concat([df.set_index('id'), df2.set_index('id')], 
                   axis='columns', keys=['First', 'Second'])
df_all

交换列级别并将相同的列名放在彼此旁边可能更容易:

df_final = df_all.swaplevel(axis='columns')[df.columns[1:]]
df_final

现在，很容易看出不同的框架。但是，我们可以进一步使用style属性来突出显示不同的单元格。我们定义了一个自定义函数来实现这一点，您可以在本部分文档中看到。

def highlight_diff(data, color='yellow'):
    attr = 'background-color: {}'.format(color)
    other = data.xs('First', axis='columns', level=-1)
    return pd.DataFrame(np.where(data.ne(other, level=0), attr, ''),
                        index=data.index, columns=data.columns)

df_final.style.apply(highlight_diff, axis=None)

这将突出显示两者都有缺失值的单元格。您可以填充它们或提供额外的逻辑，这样它们就不会被突出显示。

我遇到过这个问题，但在找到这篇文章之前找到了答案:

根据unutbu的回答，加载你的数据…

import pandas as pd
import io

texts = ['''\
id   Name   score                    isEnrolled                       Date
111  Jack                            True              2013-05-01 12:00:00
112  Nick   1.11                     False             2013-05-12 15:05:23
     Zoe    4.12                     True                                  ''',

         '''\
id   Name   score                    isEnrolled                       Date
111  Jack   2.17                     True              2013-05-01 12:00:00
112  Nick   1.21                     False                                
     Zoe    4.12                     False             2013-05-01 12:00:00''']


df1 = pd.read_fwf(io.StringIO(texts[0]), widths=[5,7,25,17,20], parse_dates=[4])
df2 = pd.read_fwf(io.StringIO(texts[1]), widths=[5,7,25,17,20], parse_dates=[4])

定义你的diff函数…

def report_diff(x):
    return x[0] if x[0] == x[1] else '{} | {}'.format(*x)

然后你可以简单地使用Panel来总结:

my_panel = pd.Panel(dict(df1=df1,df2=df2))
print my_panel.apply(report_diff, axis=0)

#          id  Name        score    isEnrolled                       Date
#0        111  Jack   nan | 2.17          True        2013-05-01 12:00:00
#1        112  Nick  1.11 | 1.21         False  2013-05-12 15:05:23 | NaT
#2  nan | nan   Zoe         4.12  True | False  NaT | 2013-05-01 12:00:00

顺便说一下，如果你在IPython Notebook中，你可能喜欢使用彩色差异函数 根据单元格是否不同、相等或左/右为空来给出颜色:

from IPython.display import HTML
pd.options.display.max_colwidth = 500  # You need this, otherwise pandas
#                          will limit your HTML strings to 50 characters

def report_diff(x):
    if x[0]==x[1]:
        return unicode(x[0].__str__())
    elif pd.isnull(x[0]) and pd.isnull(x[1]):
        return u'<table style="background-color:#00ff00;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % ('nan', 'nan')
    elif pd.isnull(x[0]) and ~pd.isnull(x[1]):
        return u'<table style="background-color:#ffff00;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % ('nan', x[1])
    elif ~pd.isnull(x[0]) and pd.isnull(x[1]):
        return u'<table style="background-color:#0000ff;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % (x[0],'nan')
    else:
        return u'<table style="background-color:#ff0000;font-weight:bold;">'+\
            '<tr><td>%s</td></tr><tr><td>%s</td></tr></table>' % (x[0], x[1])

HTML(my_panel.apply(report_diff, axis=0).to_html(escape=False))

如果两个数据帧中有相同的id，那么找出发生了什么变化实际上是相当容易的。只要执行frame1 != frame2，就会得到一个布尔型的DataFrame，其中每个True都是已更改的数据。由此，您可以通过执行changedids = frame1.index[np。Any (frame1 != frame2,axis=1)]。