我想逐行读取一个大文件(>5GB),而不将其全部内容加载到内存中。我不能使用readlines(),因为它在内存中创建了一个非常大的列表。
当前回答
当您希望并行工作并只读取数据块,但要用新行保持数据整洁时,这可能很有用。
def readInChunks(fileObj, chunkSize=1024):
while True:
data = fileObj.read(chunkSize)
if not data:
break
while data[-1:] != '\n':
data+=fileObj.read(1)
yield data
其他回答
这个怎么样? 将文件划分为块,然后逐行读取,因为当您读取文件时,操作系统将缓存下一行。如果逐行读取文件,则不能有效利用缓存的信息。
相反,将文件划分为块,并将整个块加载到内存中,然后进行处理。
def chunks(file,size=1024):
while 1:
startat=fh.tell()
print startat #file's object current position from the start
fh.seek(size,1) #offset from current postion -->1
data=fh.readline()
yield startat,fh.tell()-startat #doesnt store whole list in memory
if not data:
break
if os.path.isfile(fname):
try:
fh=open(fname,'rb')
except IOError as e: #file --> permission denied
print "I/O error({0}): {1}".format(e.errno, e.strerror)
except Exception as e1: #handle other exceptions such as attribute errors
print "Unexpected error: {0}".format(e1)
for ele in chunks(fh):
fh.seek(ele[0])#startat
data=fh.read(ele[1])#endat
print data
我不敢相信这能像@john-la-rooy的回答看起来那么简单。因此,我使用逐行读写重新创建了cp命令。这是疯狂的快。
#!/usr/bin/env python3.6
import sys
with open(sys.argv[2], 'w') as outfile:
with open(sys.argv[1]) as infile:
for line in infile:
outfile.write(line)
老派方法:
fh = open(file_name, 'rt')
line = fh.readline()
while line:
# do stuff with line
line = fh.readline()
fh.close()
这是我找到的最佳解决方案,我在330 MB的文件上尝试了一下。
lineno = 500
line_length = 8
with open('catfour.txt', 'r') as file:
file.seek(lineno * (line_length + 2))
print(file.readline(), end='')
其中line_length是单行中的字符数。例如,“abcd”的行长为4。
我添加了2个行长来跳过'\n'字符并移动到下一个字符。
下面是加载任何大小的文本文件而不会导致内存问题的代码。 它支持千兆字节大小的文件
https://gist.github.com/iyvinjose/e6c1cb2821abd5f01fd1b9065cbc759d
下载文件data_loading_utils.py并将其导入到代码中
使用
import data_loading_utils.py.py
file_name = 'file_name.ext'
CHUNK_SIZE = 1000000
def process_lines(data, eof, file_name):
# check if end of file reached
if not eof:
# process data, data is one single line of the file
else:
# end of file reached
data_loading_utils.read_lines_from_file_as_data_chunks(file_name, chunk_size=CHUNK_SIZE, callback=self.process_lines)
Process_lines方法是回调函数。它将对所有行调用,参数数据每次表示文件的一行。
您可以根据您的机器硬件配置来配置变量CHUNK_SIZE。
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