我想逐行读取一个大文件(>5GB),而不将其全部内容加载到内存中。我不能使用readlines(),因为它在内存中创建了一个非常大的列表。


当前回答

在文件对象上使用for循环逐行读取。使用open(…)让上下文管理器确保文件读取后关闭:

with open("log.txt") as infile:
    for line in infile:
        print(line)

其他回答

老派方法:

fh = open(file_name, 'rt')
line = fh.readline()
while line:
    # do stuff with line
    line = fh.readline()
fh.close()

这是我找到的最佳解决方案,我在330 MB的文件上尝试了一下。

lineno = 500
line_length = 8
with open('catfour.txt', 'r') as file:
    file.seek(lineno * (line_length + 2))
    print(file.readline(), end='')

其中line_length是单行中的字符数。例如,“abcd”的行长为4。

我添加了2个行长来跳过'\n'字符并移动到下一个字符。

blaze项目在过去6年里取得了长足的进展。它有一个简单的API,涵盖了pandas功能的一个有用子集。

dask。Dataframe内部负责分块,支持许多可并行操作,并允许您轻松地将切片导出回pandas,以便在内存中操作。

import dask.dataframe as dd

df = dd.read_csv('filename.csv')
df.head(10)  # return first 10 rows
df.tail(10)  # return last 10 rows

# iterate rows
for idx, row in df.iterrows():
    ...

# group by my_field and return mean
df.groupby(df.my_field).value.mean().compute()

# slice by column
df[df.my_field=='XYZ'].compute()

当您希望并行工作并只读取数据块,但要用新行保持数据整洁时,这可能很有用。

def readInChunks(fileObj, chunkSize=1024):
    while True:
        data = fileObj.read(chunkSize)
        if not data:
            break
        while data[-1:] != '\n':
            data+=fileObj.read(1)
        yield data

下面是加载任何大小的文本文件而不会导致内存问题的代码。 它支持千兆字节大小的文件

https://gist.github.com/iyvinjose/e6c1cb2821abd5f01fd1b9065cbc759d

下载文件data_loading_utils.py并将其导入到代码中

使用

import data_loading_utils.py.py
file_name = 'file_name.ext'
CHUNK_SIZE = 1000000


def process_lines(data, eof, file_name):

    # check if end of file reached
    if not eof:
         # process data, data is one single line of the file

    else:
         # end of file reached

data_loading_utils.read_lines_from_file_as_data_chunks(file_name, chunk_size=CHUNK_SIZE, callback=self.process_lines)

Process_lines方法是回调函数。它将对所有行调用,参数数据每次表示文件的一行。

您可以根据您的机器硬件配置来配置变量CHUNK_SIZE。