我想逐行读取一个大文件(>5GB),而不将其全部内容加载到内存中。我不能使用readlines(),因为它在内存中创建了一个非常大的列表。
当前回答
blaze项目在过去6年里取得了长足的进展。它有一个简单的API,涵盖了pandas功能的一个有用子集。
dask。Dataframe内部负责分块,支持许多可并行操作,并允许您轻松地将切片导出回pandas,以便在内存中操作。
import dask.dataframe as dd
df = dd.read_csv('filename.csv')
df.head(10) # return first 10 rows
df.tail(10) # return last 10 rows
# iterate rows
for idx, row in df.iterrows():
...
# group by my_field and return mean
df.groupby(df.my_field).value.mean().compute()
# slice by column
df[df.my_field=='XYZ'].compute()
其他回答
如果你在文件中没有换行符,你可以这样做:
with open('large_text.txt') as f:
while True:
c = f.read(1024)
if not c:
break
print(c,end='')
请试试这个:
with open('filename','r',buffering=100000) as f:
for line in f:
print line
这是我找到的最佳解决方案,我在330 MB的文件上尝试了一下。
lineno = 500
line_length = 8
with open('catfour.txt', 'r') as file:
file.seek(lineno * (line_length + 2))
print(file.readline(), end='')
其中line_length是单行中的字符数。例如,“abcd”的行长为4。
我添加了2个行长来跳过'\n'字符并移动到下一个字符。
当您希望并行工作并只读取数据块,但要用新行保持数据整洁时,这可能很有用。
def readInChunks(fileObj, chunkSize=1024):
while True:
data = fileObj.read(chunkSize)
if not data:
break
while data[-1:] != '\n':
data+=fileObj.read(1)
yield data
最好使用迭代器。 相关:fileinput -迭代多个输入流中的行。
从文档中可以看出:
import fileinput
for line in fileinput.input("filename", encoding="utf-8"):
process(line)
这将避免将整个文件一次复制到内存中。
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