在三维空间中有两个点

a = (ax, ay, az)
b = (bx, by, bz)

我想计算它们之间的距离:

dist = sqrt((ax-bx)^2 + (ay-by)^2 + (az-bz)^2)

我如何用NumPy做到这一点?我有:

import numpy
a = numpy.array((ax, ay, az))
b = numpy.array((bx, by, bz))

当前回答

其他答案适用于浮点数,但不能正确计算整数dtype的距离,因为整数dtype容易溢出和下溢。注意,即使scipy.distance.euclidean也有这个问题:

>>> a1 = np.array([1], dtype='uint8')
>>> a2 = np.array([2], dtype='uint8')
>>> a1 - a2
array([255], dtype=uint8)
>>> np.linalg.norm(a1 - a2)
255.0
>>> from scipy.spatial import distance
>>> distance.euclidean(a1, a2)
255.0

这是很常见的,因为许多图像库将图像表示为dtype="uint8"的ndarray。这意味着,如果你有一个由深灰色像素组成的灰度图像(比如所有像素的颜色都是#000001),你将它与黑色图像(#000000)进行区分,你最终可以在所有单元格中得到x-y为255的图像,这表明两张图像彼此相距很远。对于无符号整数类型(例如uint8),你可以安全地在numpy中计算距离:

np.linalg.norm(np.maximum(x, y) - np.minimum(x, y))

对于有符号整型,可以先转换为浮点类型:

np.linalg.norm(x.astype("float") - y.astype("float"))

对于图像数据,你可以使用opencv的norm方法:

import cv2
cv2.norm(x, y, cv2.NORM_L2)

其他回答

使用numpy.linalg.norm:

dist = numpy.linalg.norm(a-b)

这是因为欧氏距离是l2范数,而numpy.linalg.norm中ord参数的默认值是2。 要了解更多理论,请参阅数据挖掘介绍:

使用Python 3.8,这非常简单。

https://docs.python.org/3/library/math.html#math.dist

math.dist(p, q)

返回给定两点p和q之间的欧氏距离 作为坐标序列(或可迭代对象)。这两点一定有 相同的维度。 大致相当于: √(sum((px - qx) ** 2.0 for px, qx in zip(p, q)))

这里有一些简洁的Python欧几里得距离代码,给出了Python中以列表表示的两个点。

def distance(v1,v2): 
    return sum([(x-y)**2 for (x,y) in zip(v1,v2)])**(0.5)
import numpy as np
from scipy.spatial import distance
input_arr = np.array([[0,3,0],[2,0,0],[0,1,3],[0,1,2],[-1,0,1],[1,1,1]]) 
test_case = np.array([0,0,0])
dst=[]
for i in range(0,6):
    temp = distance.euclidean(test_case,input_arr[i])
    dst.append(temp)
print(dst)

使用scipy.spatial.distance.euclidean:

from scipy.spatial import distance
a = (1, 2, 3)
b = (4, 5, 6)
dst = distance.euclidean(a, b)