可以对变量使用facet_wrap(~ variable, ncol=)来创建一个新的比较。它们不在同一个轴上，但很相似。

我承认并同意哈德利(和其他人)的观点，即单独的y量表“存在根本缺陷”。说到这里，我经常希望ggplot2有这个特性——特别是当数据是宽格式的，并且我想快速地可视化或检查数据时(即仅供个人使用)。

虽然tidyverse库可以很容易地将数据转换为长格式(这样facet_grid()就可以工作)，但这个过程仍然不是简单的，如下所示:

library(tidyverse)
df.wide %>%
    # Select only the columns you need for the plot.
    select(date, column1, column2, column3) %>%
    # Create an id column – needed in the `gather()` function.
    mutate(id = n()) %>%
    # The `gather()` function converts to long-format. 
    # In which the `type` column will contain three factors (column1, column2, column3),
    # and the `value` column will contain the respective values.
    # All the while we retain the `id` and `date` columns.
    gather(type, value, -id, -date) %>%
    # Create the plot according to your specifications
    ggplot(aes(x = date, y = value)) +
        geom_line() +
        # Create a panel for each `type` (ie. column1, column2, column3).
        # If the types have different scales, you can use the `scales="free"` option.
        facet_grid(type~., scales = "free")

这是我对如何做二次轴变换的两种看法。首先，您希望将主数据和辅助数据的范围耦合起来。这通常是混乱的，因为您不想要的变量污染了全局环境。

为了简化这一点，我们将创建一个生成两个函数的函数工厂，其中scales::rescale()完成所有繁重的工作。因为这些是闭包，所以它们知道创建它们的环境，所以它们“有”创建之前生成的to和from参数的“内存”。

一个函数进行正向转换:将辅助数据转换为主要尺度。 第二个函数进行反向转换:将主要单位中的数据转换为次要单位。

library(ggplot2)
library(scales)

# Function factory for secondary axis transforms
train_sec <- function(primary, secondary, na.rm = TRUE) {
  # Thanks Henry Holm for including the na.rm argument!
  from <- range(secondary, na.rm = na.rm)
  to   <- range(primary, na.rm = na.rm)
  # Forward transform for the data
  forward <- function(x) {
    rescale(x, from = from, to = to)
  }
  # Reverse transform for the secondary axis
  reverse <- function(x) {
    rescale(x, from = to, to = from)
  }
  list(fwd = forward, rev = reverse)
}

这看起来相当复杂，但是创建函数工厂会使其余的一切变得更简单。现在，在绘制图形之前，我们将通过向工厂显示主要和次要数据来生成相关函数。我们将使用经济学数据集，它的失业列和pasavert列的范围非常不同。

sec <- with(economics, train_sec(unemploy, psavert))

然后我们使用y = sec$fwd(psavert)将辅助数据重新缩放到主轴，并指定~ sec$rev(.)作为辅助轴的转换参数。这给了我们一个主要范围和次要范围在图上占据相同空间的图。

ggplot(economics, aes(date)) +
  geom_line(aes(y = unemploy), colour = "blue") +
  geom_line(aes(y = sec$fwd(psavert)), colour = "red") +
  scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~sec$rev(.), name = "psavert"))

工厂比这稍微灵活一些，因为如果您只是想重新调整最大值，您可以传入下限为0的数据。

# Rescaling the maximum
sec <- with(economics, train_sec(c(0, max(unemploy)),
                                 c(0, max(psavert))))

ggplot(economics, aes(date)) +
  geom_line(aes(y = unemploy), colour = "blue") +
  geom_line(aes(y = sec$fwd(psavert)), colour = "red") +
  scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~sec$rev(.), name = "psavert"))

由reprex包于2021-02-05创建(v0.3.0)

我承认这个例子中的区别不是很明显，但如果你仔细观察，你会发现最大值是相同的，红线比蓝色的线低。

编辑:

这种方法现在已经在ggh4x包中的help_secondary()函数中被捕获和扩展。声明:我是ggh4x的作者。

Hadley的回答参考了Stephen Few的报告《双缩放轴在图中是最好的解决方案吗?》

我不知道OP中的“counts”和“rate”是什么意思，但快速搜索会给我counts和Rates，所以我得到了一些关于北美登山事故的数据:

Years<-c("1998","1999","2000","2001","2002","2003","2004")
Persons.Involved<-c(281,248,301,276,295,231,311)
Fatalities<-c(20,17,24,16,34,18,35)
rate=100*Fatalities/Persons.Involved
df<-data.frame(Years=Years,Persons.Involved=Persons.Involved,Fatalities=Fatalities,rate=rate)
print(df,row.names = FALSE)

 Years Persons.Involved Fatalities      rate
  1998              281         20  7.117438
  1999              248         17  6.854839
  2000              301         24  7.973422
  2001              276         16  5.797101
  2002              295         34 11.525424
  2003              231         18  7.792208
  2004              311         35 11.254019

然后，我尝试按照Few在上述报告第7页建议的那样绘制图表(并按照OP的要求将计数绘制为柱状图，将率绘制为折线图):

The other less obvious solution, which works only for time series, is to convert all sets of values to a common quantitative scale by displaying percentage differences between each value and a reference (or index) value. For instance, select a particular point in time, such as the first interval that appears in the graph, and express each subsequent value as the percentage difference between it and the initial value. This is done by dividing the value at each point in time by the value for the initial point in time and then multiplying it by 100 to convert the rate to a percentage, as illustrated below.

df2<-df
df2$Persons.Involved <- 100*df$Persons.Involved/df$Persons.Involved[1]
df2$rate <- 100*df$rate/df$rate[1]
plot(ggplot(df2)+
  geom_bar(aes(x=Years,weight=Persons.Involved))+
  geom_line(aes(x=Years,y=rate,group=1))+
  theme(text = element_text(size=30))
  )

这就是结果:

但我不是很喜欢它，我不能轻易地给它加上一个传奇……

1 威廉森，杰德，等人。2005年北美登山事故。The Mountaineers Books, 2005。

从ggplot2 2.2.0开始，您可以添加如下的辅助轴(取自ggplot2 2.2.0公告):

ggplot(mpg, aes(displ, hwy)) + 
  geom_point() + 
  scale_y_continuous(
    "mpg (US)", 
    sec.axis = sec_axis(~ . * 1.20, name = "mpg (UK)")
  )

总有办法的。

这里有一个解决方案，允许完全任意轴而不重新缩放。其思想是生成两个除了轴以外完全相同的图，并使用cowplot包中的insert_yaxis_grob和get_y_axis函数将它们组合在一起。

library(ggplot2)
library(cowplot)

## first plot 
p1 <- ggplot(mtcars,aes(disp,hp,color=as.factor(am))) + 
    geom_point() + theme_bw() + theme(legend.position='top', text=element_text(size=16)) +
    ylab("Horse points" )+ xlab("Display size") + scale_color_discrete(name='Transmitter') +
    stat_smooth(se=F)

## same plot with different, arbitrary scale   
p2 <- p1 +
    scale_y_continuous(position='right',breaks=seq(120,173,length.out = 3),
                       labels=c('little','medium little','medium hefty'))

ggdraw(insert_yaxis_grob(p1,get_y_axis(p2,position='right')))