我想用IPython笔记本电脑来交互式分析我用Biopython的基因组图模块制作的一些基因组图。虽然有大量关于如何使用matplotlib在IPython笔记本中获得内联图形的文档，但GenomeDiagram使用ReportLab工具包，我认为IPython不支持该工具包。
然而，我在想，一种解决这个问题的方法是将绘图/基因组图写入一个文件，然后内联打开图像，结果会是这样的:
gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")
然而，我不知道如何做到这一点，也不知道这是否可行。那么有人知道IPython中是否可以打开/显示图像吗?
当前回答
这将在Jupyter中导入并显示。jpg图像(在Anaconda环境中使用Python 2.7测试)
from IPython.display import display
from PIL import Image
path="/path/to/image.jpg"
display(Image.open(path))
您可能需要安装PIL
在《Anaconda》中，这是通过输入完成的
conda install pillow
其他回答
另一个选择是:
from matplotlib import pyplot as plt
from io import BytesIO
from PIL import Image
import Ipython
f = BytesIO()
plt.savefig(f, format='png')
Ipython.display.display(Ipython.display.Image(data=f.getvalue()))
f.close()
如果试图在循环中以这种方式显示Image，则需要将Image构造函数包装在显示方法中。
from IPython.display import Image, display
listOfImageNames = ['/path/to/images/1.png',
'/path/to/images/2.png']
for imageName in listOfImageNames:
display(Image(filename=imageName))
注意，到目前为止发布的解决方案只适用于png和jpg!
如果你想让它更简单，而不需要导入更多的库，或者你想在你的Ipython Notebook中显示一个动画或非动画的GIF文件。转换行，你想显示它markdown和使用这个漂亮的短hack!
from IPython.display import Image
Image(filename =r'C:\user\path')
我见过一些解决方案，有些不会工作，因为原始目录，当添加像上面这样的代码时，只记得在目录前添加'r'。这应该可以避免这种错误:(unicode error)'unicodeescape'编解码器无法解码位置2-3中的字节:截断的\UXXXXXXXX转义
一个更干净的Python3版本，使用标准numpy, matplotlib和PIL。合并从URL打开的答案。
import matplotlib.pyplot as plt
from PIL import Image
import numpy as np
pil_im = Image.open('image.png') #Take jpg + png
## Uncomment to open from URL
#import requests
#r = requests.get('https://www.vegvesen.no/public/webkamera/kamera?id=131206')
#pil_im = Image.open(BytesIO(r.content))
im_array = np.asarray(pil_im)
plt.imshow(im_array)
plt.show()
