我想用IPython笔记本电脑来交互式分析我用Biopython的基因组图模块制作的一些基因组图。虽然有大量关于如何使用matplotlib在IPython笔记本中获得内联图形的文档，但GenomeDiagram使用ReportLab工具包，我认为IPython不支持该工具包。
然而，我在想，一种解决这个问题的方法是将绘图/基因组图写入一个文件，然后内联打开图像，结果会是这样的:
gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")
然而，我不知道如何做到这一点，也不知道这是否可行。那么有人知道IPython中是否可以打开/显示图像吗?
当前回答
from IPython.display import Image
Image(filename =r'C:\user\path')
我见过一些解决方案，有些不会工作，因为原始目录，当添加像上面这样的代码时，只记得在目录前添加'r'。这应该可以避免这种错误:(unicode error)'unicodeescape'编解码器无法解码位置2-3中的字节:截断的\UXXXXXXXX转义
其他回答
如果您希望将映像从本地主机嵌入到ipython笔记本中，您可以执行以下操作:
首先:找到当前本地路径:
# show current directory
import os
cwd = os.getcwd()
cwd
例如，结果将是:
'C:\\Users\\lenovo\\Tutorials'
接下来，像下面这样嵌入你的图像:
from IPython.display import display
from PIL import Image
path="C:\\Users\\lenovo\\Tutorials\\Data_Science\\DS images\\your_image.jpeg"
display(Image.open(path))
确保您在jpg、jpeg或png中选择了正确的图像类型。
注意，到目前为止发布的解决方案只适用于png和jpg!
如果你想让它更简单，而不需要导入更多的库，或者你想在你的Ipython Notebook中显示一个动画或非动画的GIF文件。转换行，你想显示它markdown和使用这个漂亮的短hack!
通过这篇文章，你可以做到以下几点:
from IPython.display import Image
Image(filename='test.png')
(官方文档)
另一个选择是:
from matplotlib import pyplot as plt
from io import BytesIO
from PIL import Image
import Ipython
f = BytesIO()
plt.savefig(f, format='png')
Ipython.display.display(Ipython.display.Image(data=f.getvalue()))
f.close()
这将在Jupyter中导入并显示。jpg图像(在Anaconda环境中使用Python 2.7测试)
from IPython.display import display
from PIL import Image
path="/path/to/image.jpg"
display(Image.open(path))
您可能需要安装PIL
在《Anaconda》中，这是通过输入完成的
conda install pillow
