最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户,并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。

是否有一种优雅的方式来调用installed.packages(),比较那些我正在加载和安装如果丢失?


当前回答

达森·k和我有一个吃豆人包可以很好地做到这一点。包中的p_load函数执行此操作。第一行代码只是为了确保安装了pacman。

if (!require("pacman")) install.packages("pacman")
pacman::p_load(package1, package2, package_n)

其他回答

站在@MichaelChirico的肩膀上:

stopifnot(3 == length(find.package(c('foo', 'bar', 'baz'))))

您可以简单地使用setdiff函数获取未安装的包,然后安装它们。在下面的示例中,我们在安装ggplot2和Rcpp包之前检查它们是否已经安装。

unavailable <- setdiff(c("ggplot2", "Rcpp"), rownames(installed.packages()))
install.packages(unavailable)

在一行中,上面的内容可以写成:

install.packages(setdiff(c("ggplot2", "Rcpp"), rownames(installed.packages())))

当前版本的RStudio(>=1.2)包含了一个功能,可以检测library()和require()调用中缺失的包,并提示用户安装它们:

检测丢失的R包 许多R脚本打开时调用library()和require()来加载执行所需的包。如果您打开一个R脚本,该脚本引用了您没有安装的包,RStudio现在将提供一次单击即可安装所有所需的包。不再重复输入install.packages(),直到错误消失! https://blog.rstudio.com/2018/11/19/rstudio-1-2-preview-the-little-things/

这似乎很好地解决了OP最初的问题:

他们中的许多人是新手/中级R用户,并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。

达森·k和我有一个吃豆人包可以很好地做到这一点。包中的p_load函数执行此操作。第一行代码只是为了确保安装了pacman。

if (!require("pacman")) install.packages("pacman")
pacman::p_load(package1, package2, package_n)

确定。

您需要比较“已安装的包”和“所需的包”。这非常接近于我用蔓越莓做的事情,因为我需要比较“存储的已知包”和“当前已知的包”,以确定新的和/或更新的包。

就像这样

AP <- available.packages(contrib.url(repos[i,"url"]))   # available t repos[i]

为了获得所有已知的包,模拟调用当前安装的包,并将其与给定的目标包集进行比较。