最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户，并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
是否有一种优雅的方式来调用installed.packages()，比较那些我正在加载和安装如果丢失?
当前回答
确定。
您需要比较“已安装的包”和“所需的包”。这非常接近于我用蔓越莓做的事情，因为我需要比较“存储的已知包”和“当前已知的包”，以确定新的和/或更新的包。
就像这样
AP <- available.packages(contrib.url(repos[i,"url"])) # available t repos[i]
为了获得所有已知的包，模拟调用当前安装的包，并将其与给定的目标包集进行比较。
其他回答
确定。
您需要比较“已安装的包”和“所需的包”。这非常接近于我用蔓越莓做的事情，因为我需要比较“存储的已知包”和“当前已知的包”，以确定新的和/或更新的包。
就像这样
AP <- available.packages(contrib.url(repos[i,"url"])) # available t repos[i]
为了获得所有已知的包，模拟调用当前安装的包，并将其与给定的目标包集进行比较。
是的。如果您有软件包列表，请将其与installed.packages()[，"Package"]的输出进行比较，然后安装缺少的软件包。就像这样:
list.of.packages <- c("ggplot2", "Rcpp")
new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]
if(length(new.packages)) install.packages(new.packages)
否则:
如果您将代码放在包中并使它们成为依赖项，那么当您安装包时，它们将自动安装。
站在@MichaelChirico的肩膀上:
stopifnot(3 == length(find.package(c('foo', 'bar', 'baz'))))
在我的例子中，我想要一个可以从命令行(实际上是通过Makefile)运行的一行程序。下面是一个安装“VGAM”和“feather”的例子，如果它们还没有安装:
R -e 'for (p in c("VGAM", "feather")) if (!require(p, character.only=TRUE)) install.packages(p, repos="http://cran.us.r-project.org")'
在R内部，它就是:
for (p in c("VGAM", "feather")) if (!require(p, character.only=TRUE)) install.packages(p, repos="http://cran.us.r-project.org")
除了前面的解之外，这里没有别的解:
我只说一句 我硬编码回购参数(以避免任何弹出窗口询问使用的镜像) 我不想费心定义一个在其他地方使用的函数
还要注意重要的字符。only=TRUE(如果没有它，require将尝试加载包p)。
我使用以下将检查包是否安装和依赖项是否更新，然后加载包。
p<-c('ggplot2','Rcpp')
install_package<-function(pack)
{if(!(pack %in% row.names(installed.packages())))
{
update.packages(ask=F)
install.packages(pack,dependencies=T)
}
require(pack,character.only=TRUE)
}
for(pack in p) {install_package(pack)}
completeFun <- function(data, desiredCols) {
completeVec <- complete.cases(data[, desiredCols])
return(data[completeVec, ])
}
