最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户，并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
是否有一种优雅的方式来调用installed.packages()，比较那些我正在加载和安装如果丢失?
当前回答
pckg=c("shiny","ggplot2","dplyr","leaflet","lubridate","RColorBrewer","plotly","DT","shinythemes")
for(i in 1:length(pckg))
{
print(pckg[i])
if (!is.element(pckg[i], installed.packages()[,1]))
install.packages(pckg[i], dep = TRUE)
require(pckg[i], character.only = TRUE)
}
其他回答
此解决方案将获取包名的字符向量并尝试加载它们，或者在加载失败时安装它们。它依赖于require的返回行为来做到这一点，因为…
Require返回(不可见的)一个逻辑，指示所需的包是否可用
因此，我们可以简单地查看是否能够加载所需的包，如果不能，则使用依赖项安装它。所以给定一个你想要加载的包的字符向量…
foo <- function(x){
for( i in x ){
# require returns TRUE invisibly if it was able to load package
if( ! require( i , character.only = TRUE ) ){
# If package was not able to be loaded then re-install
install.packages( i , dependencies = TRUE )
# Load package after installing
require( i , character.only = TRUE )
}
}
}
# Then try/install packages...
foo( c("ggplot2" , "reshape2" , "data.table" ) )
pckg=c("shiny","ggplot2","dplyr","leaflet","lubridate","RColorBrewer","plotly","DT","shinythemes")
for(i in 1:length(pckg))
{
print(pckg[i])
if (!is.element(pckg[i], installed.packages()[,1]))
install.packages(pckg[i], dep = TRUE)
require(pckg[i], character.only = TRUE)
}
虽然Shane的回答很好，但对于我的一个项目，我需要自动删除输出消息、警告和安装包。我终于设法得到这个脚本:
InstalledPackage <- function(package)
{
available <- suppressMessages(suppressWarnings(sapply(package, require, quietly = TRUE, character.only = TRUE, warn.conflicts = FALSE)))
missing <- package[!available]
if (length(missing) > 0) return(FALSE)
return(TRUE)
}
CRANChoosen <- function()
{
return(getOption("repos")["CRAN"] != "@CRAN@")
}
UsePackage <- function(package, defaultCRANmirror = "http://cran.at.r-project.org")
{
if(!InstalledPackage(package))
{
if(!CRANChoosen())
{
chooseCRANmirror()
if(!CRANChoosen())
{
options(repos = c(CRAN = defaultCRANmirror))
}
}
suppressMessages(suppressWarnings(install.packages(package)))
if(!InstalledPackage(package)) return(FALSE)
}
return(TRUE)
}
Use:
libraries <- c("ReadImages", "ggplot2")
for(library in libraries)
{
if(!UsePackage(library))
{
stop("Error!", library)
}
}
下面这个简单的函数非常好用:
usePackage<-function(p){
# load a package if installed, else load after installation.
# Args:
# p: package name in quotes
if (!is.element(p, installed.packages()[,1])){
print(paste('Package:',p,'Not found, Installing Now...'))
install.packages(p, dep = TRUE)}
print(paste('Loading Package :',p))
require(p, character.only = TRUE)
}
(不是我的，一段时间前在网上找到了这个，从那时起就一直在使用它。不确定原始来源)
你可以使用find.package()。
这里几乎所有的答案都依赖于(1)require()或(2)installed.packages()来检查给定的包是否已经安装。
我添加了一个答案，因为这些对于回答这个问题的轻量级方法来说是不令人满意的。
Require具有加载包的名称空间的副作用，这可能并不总是可取的 安装。Packages是点燃蜡烛的火箭筒——它将首先检查所有已安装的包，然后我们检查这个库中是否有一个(或几个)包“库存”。没有必要为了找一根针而堆一堆干草堆。
这个答案也是受到@ArtemKlevtsov的启发，以类似的精神回答了这个问题的复制版本。他指出system.file(package=x)可以达到预期的效果，即返回“如果包未安装，则返回nchar > 1”。
如果我们深入了解系统。File实现了这个，我们可以看到它使用了不同的基函数find。包，我们可以直接使用:
# a package that exists
find.package('data.table', quiet=TRUE)
# [1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/data.table"
# a package that does not
find.package('InstantaneousWorldPeace', quiet=TRUE)
# character(0)
我们还可以在find中查看引擎盖下的内容。包来看看它是如何工作的，但这主要是一个有指导意义的练习——我看到的唯一简化函数的方法是跳过一些健壮性检查。但是基本的想法是:在. libpaths()中查找——任何安装的包pkg将在file.path(. libpaths ()， pkg)处有一个DESCRIPTION文件，因此快速检查file.exists(file.path(. libpaths ()， pkg， 'DESCRIPTION')。
