最近我似乎和合作者分享了很多代码。他们中的许多人是新手/中级R用户，并没有意识到他们必须安装他们还没有的包。
是否有一种优雅的方式来调用installed.packages()，比较那些我正在加载和安装如果丢失?
当前回答
是的。如果您有软件包列表，请将其与installed.packages()[，"Package"]的输出进行比较，然后安装缺少的软件包。就像这样:
list.of.packages <- c("ggplot2", "Rcpp")
new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]
if(length(new.packages)) install.packages(new.packages)
否则:
如果您将代码放在包中并使它们成为依赖项，那么当您安装包时，它们将自动安装。
其他回答
你可以使用require的返回值:
if(!require(somepackage)){
install.packages("somepackage")
library(somepackage)
}
我在安装后使用library，因为如果安装不成功或由于其他原因无法加载包，它将抛出异常。您可以使其更加健壮和可重用:
dynamic_require <- function(package){
if(eval(parse(text=paste("require(",package,")")))) return(TRUE)
install.packages(package)
return(eval(parse(text=paste("require(",package,")"))))
}
此方法的缺点是必须以引号传递包名，而对于真正的require则不这样做。
非常基本的一个。
pkgs = c("pacman","data.table")
if(length(new.pkgs <- setdiff(pkgs, rownames(installed.packages())))) install.packages(new.pkgs)
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
if (!require("ggsci")) biocLite("ggsci")
是的。如果您有软件包列表，请将其与installed.packages()[，"Package"]的输出进行比较，然后安装缺少的软件包。就像这样:
list.of.packages <- c("ggplot2", "Rcpp")
new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]
if(length(new.packages)) install.packages(new.packages)
否则:
如果您将代码放在包中并使它们成为依赖项，那么当您安装包时，它们将自动安装。
# List of packages for session
.packages = c("ggplot2", "plyr", "rms")
# Install CRAN packages (if not already installed)
.inst <- .packages %in% installed.packages()
if(length(.packages[!.inst]) > 0) install.packages(.packages[!.inst])
# Load packages into session
lapply(.packages, require, character.only=TRUE)
