我有警告，也不能在XCode下提交更改(使用svn)。我所要做的就是重新启动XCode，问题就消失了。

在我的例子中，Xcode以某种方式找到了引用丢失文件的旧.svn目录。我必须在我的项目文件夹上一个级别才能找到那些.svn文件。删除后，我重新启动Xcode，一切正常。

一旦你提交了修改，警告就会消失(Xcode 8)。

这对我来说很管用: Xcode ->(“选项+点击”)产品->清洁构建文件夹… 而不是重启xCode

这肯定与源代码控制有关。我重命名并移动了几个未提交的plist文件，得到了这个错误。我使用svn。我可以通过源代码控制-提交删除旧的引用文件来修复这个问题。

在我的案例中，这是git和不区分大小写的文件系统的问题。

我无意中提交了两次相同的文件，使用的文件路径只在以防万一时不同:

MyProject/Resources/foo.png
MyProject/resources/foo.png

Xcode抱怨丢失了一个文件。

修正删除违规文件，并重新添加。

cd MyProject
mv Resources/foo.png /tmp
git rm Resources/foo.png
git rm resources/foo.png
git commit
mv /tmp/foo.png Resources
git add Resources/foo.png
git commit