禁用源代码控制，清除构建文件夹(Alt+Shift+Cmd+K)，然后再次启用源代码控制。

Xcode ->首选项->源控制->启用源控制

当我还在使用Xcode 7时，我的Xcode项目中有几个文件早就被删除了，我也遇到了类似的问题。

我的解决方案是:

用Xcode抱怨的名字创建文件(他们不需要任何内容) 将文件添加到我的Xcode项目(在Xcode中右键单击我的主项目目录，单击Add files to my_project_name，并选择刚刚创建的文件 选择新添加的文件并删除它们-选择移动到垃圾。

这让我摆脱了警告。

一旦你提交了修改，警告就会消失(Xcode 8)。

这对我来说很管用: Xcode ->(“选项+点击”)产品->清洁构建文件夹… 而不是重启xCode

这肯定与源代码控制有关。我重命名并移动了几个未提交的plist文件，得到了这个错误。我使用svn。我可以通过源代码控制-提交删除旧的引用文件来修复这个问题。

这个问题似乎有不同的原因，但它通常与源代码控制软件有关。

在我的例子中，我通过转到Git并再次添加文件来解决这个问题。我的意思是运行以下命令:

git add .