再加上亚历山大·瓦塞宁的答案……

首先，我承诺并推动我的改变

Xcode主菜单>源代码控制>提交

然后我放弃了所有的更改，以摆脱错误

Xcode主菜单>源代码控制>放弃所有更改

在此之后，“文件xxx.png从工作副本中丢失”的错误消失了。

显示在目标->构建阶段->拷贝Bundle资源。 和 清除构建文件夹命令+shift+alt+k

我有同样的问题，并解决了它添加git。 打开命令行工具

cd "project folder path"
git add .

之后，重新启动Xcode项目并再次打开你的项目。

一旦你提交了修改，警告就会消失(Xcode 8)。

我有警告，也不能在XCode下提交更改(使用svn)。我所要做的就是重新启动XCode，问题就消失了。

我不得不手动进入终端，用git rm ProjectPath\aaa\xxx.png删除文件，然后提交。从那以后，一切都很顺利。