在我的案例中，这是git和不区分大小写的文件系统的问题。

我无意中提交了两次相同的文件，使用的文件路径只在以防万一时不同:

MyProject/Resources/foo.png
MyProject/resources/foo.png

Xcode抱怨丢失了一个文件。

修正删除违规文件，并重新添加。

cd MyProject
mv Resources/foo.png /tmp
git rm Resources/foo.png
git rm resources/foo.png
git commit
mv /tmp/foo.png Resources
git add Resources/foo.png
git commit

我有警告，也不能在XCode下提交更改(使用svn)。我所要做的就是重新启动XCode，问题就消失了。

在我的案例中，这是git和不区分大小写的文件系统的问题。

我无意中提交了两次相同的文件，使用的文件路径只在以防万一时不同:

MyProject/Resources/foo.png
MyProject/resources/foo.png

Xcode抱怨丢失了一个文件。

修正删除违规文件，并重新添加。

cd MyProject
mv Resources/foo.png /tmp
git rm Resources/foo.png
git rm resources/foo.png
git commit
mv /tmp/foo.png Resources
git add Resources/foo.png
git commit

在XCode 8之后的每个项目中都有这个。这就解决了问题:

与选项键按下，产品(在标题菜单)->清洁构建文件夹。

显示在目标->构建阶段->拷贝Bundle资源。 和 清除构建文件夹命令+shift+alt+k

在我的例子中，Xcode以某种方式找到了引用丢失文件的旧.svn目录。我必须在我的项目文件夹上一个级别才能找到那些.svn文件。删除后，我重新启动Xcode，一切正常。