将注释放在非eval、非echo R块中怎么样？即。，

```{r echo=FALSE, eval=FALSE}
All the comments!
```

对我来说似乎很好。

您可以这样做（YAML块）：

~~~
# This is a
# multiline
# comment
...

我只尝试了乳胶输出，请为其他人确认。

披露：我写了这个插件。

由于问题没有指定特定的markdown实现，我想提到python markdown的Comments插件，它实现了上述相同的pandoc注释样式。

这项小型研究证明并完善了马格努斯的答案

最独立于平台的语法是

(empty line)
[comment]: # (This actually is the most platform independent comment)

这两个条件都很重要：

使用#（而不是<>）注释前有空行。注释后的空行对结果没有影响。

严格的Markdown规范CommonMark仅适用于此语法（而不适用于<>和/或空行）

为了证明这一点，我们将使用Alexandre Mutel的Babelmark I。该工具检查大量Markdown实现上特定源代码的呈现。

（+-通过了测试，--没有通过，？-留下一些垃圾，这些垃圾在呈现的HTML中没有显示）。

无空行，使用<>13+15-注释前空行，使用<>20+，8-注释周围的空行，使用<>20+，8-没有空行，使用#13+1？14-注释前空行，使用#23+1？4-注释周围的空行，使用#23+1？4-带有3个连字符1+2的HTML注释？25-来自chl的答案（注意这是不同的语法）

这证明了上述陈述。

这些实现未通过所有7项测试。没有机会对它们使用excluded on render注释。

cebe/markdown 1.1.0cebe/markdown markdown额外1.1.0cebe/markdown GFM 1.1.0s9e\TextFormatter（Fatdown/PHP）

我编写了一个小awk程序来过滤添加到文本中的#omitbegine和#omitend标记。我使用awk将其输出通过管道传输到pandoc可以处理的临时文件。像这样：

awk-f省略过滤器.awk aim2_article.md>aim2_aArticle_tmp.md

pandoc--pdf engine=xelatex--lua filter=pagebreak.lua--filter pandoc crossref--citeproc aim2_article_tmp.md-o aim2_aarticle.pdf

这里是省略筛选器.awk：

/#omitbegin/ {
    insideOmit = 1;
}

! insideOmit {
    print $0
}

/#omitend/ {
    insideOmit = 0;
}

我相信，所有先前提出的解决方案（除了那些需要特定实现的解决方案）都会导致注释包含在输出HTML中，即使它们没有显示出来。

如果你想要一个完全属于你自己的评论（转换文档的读者应该看不到它，即使使用“查看源代码”），你可以（ab）使用核心Markdown规范中提供的链接标签（用于参考样式链接）：

http://daringfireball.net/projects/markdown/syntax#link

即：

[comment]: <> (This is a comment, it will not be included)
[comment]: <> (in  the output file unless you use it in)
[comment]: <> (a reference style link.)

或者您可以进一步：

[//]: <> (This is also a comment.)

为了提高平台兼容性（并节省一次按键），也可以使用#（这是合法的超链接目标）而不是<>：

[//]: # (This may be the most platform independent comment)

为了实现最大的可移植性，在这种类型的注释前后插入一个空行是很重要的，因为某些Markdown解析器在定义碰到常规文本时无法正常工作。Babelmark的最新研究表明，前后空白行都很重要。如果前面没有空行，一些解析器将输出注释，如果后面没有空行则一些解析器将排除以下行。

通常，这种方法应该适用于大多数Markdown解析器，因为它是核心规范的一部分。（即使定义了多个链接时的行为，或定义了链接但从未使用时的行为也未严格指定）。