我有一个嵌套的数据列表。它的长度是132,每一项是一个长度为20的列表。是否有一种快速的方法可以将这种结构转换为具有132行和20列数据的数据帧?

下面是一些示例数据:

l <- replicate(
  132,
  as.list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

当前回答

或者你可以使用tibble包(来自tidyverse):

#create examplelist
l <- replicate(
  132,
  as.list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

#package tidyverse
library(tidyverse)

#make a dataframe (or use as_tibble)
df <- as_data_frame(l,.name_repair = "unique")



其他回答

修正样本数据,使其符合原始描述“每个项目是一个长度为20的列表”

mylistlist <- replicate(
  132,
  as.list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

我们可以像这样把它转换成一个数据帧:

data.frame(t(sapply(mylistlist,c)))

Sapply将其转换为矩阵。 data.frame将矩阵转换为数据帧。

导致:

对于使用purrr系列解决方案的并行(多核,多会话等)解决方案,使用:

library (furrr)
plan(multisession) # see below to see which other plan() is the more efficient
myTibble <- future_map_dfc(l, ~.x)

其中l是列表。

要对最有效的计划()进行基准测试,您可以使用:

library(tictoc)
plan(sequential) # reference time
# plan(multisession) # benchamark plan() goes here. See ?plan().
tic()
myTibble <- future_map_dfc(l, ~.x)
toc()

该方法使用一个tidyverse包(purrr)。

列表:

x <- as.list(mtcars)

将其转换为数据帧(更具体地说是tibble):

library(purrr)
map_df(x, ~.x)

编辑时间:2021年5月30日

这实际上可以通过dplyr中的bind_rows()函数实现。

x <- as.list(mtcars)
dplyr::bind_rows(x)

 A tibble: 32 x 11
     mpg   cyl  disp    hp  drat    wt  qsec    vs    am  gear  carb
   <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
 1  21       6  160    110  3.9   2.62  16.5     0     1     4     4
 2  21       6  160    110  3.9   2.88  17.0     0     1     4     4
 3  22.8     4  108     93  3.85  2.32  18.6     1     1     4     1
 4  21.4     6  258    110  3.08  3.22  19.4     1     0     3     1
 5  18.7     8  360    175  3.15  3.44  17.0     0     0     3     2
 6  18.1     6  225    105  2.76  3.46  20.2     1     0     3     1
 7  14.3     8  360    245  3.21  3.57  15.8     0     0     3     4
 8  24.4     4  147.    62  3.69  3.19  20       1     0     4     2
 9  22.8     4  141.    95  3.92  3.15  22.9     1     0     4     2
10  19.2     6  168.   123  3.92  3.44  18.3     1     0     4     4
# ... with 22 more rows

我发现的每个解决方案似乎只适用于列表中的每个对象都具有相同的长度。当列表中对象的长度不相等时,我需要将列表转换为data.frame。下面是我提出的基于R的解决方案。毫无疑问,这是非常低效的,但它似乎确实有效。

x1 <- c(2, 13)
x2 <- c(2, 4, 6, 9, 11, 13)
x3 <- c(1, 1, 2, 3, 3, 4, 5, 5, 6, 7, 7, 8, 9, 9, 10, 11, 11, 12, 13, 13)
my.results <- list(x1, x2, x3)

# identify length of each list
my.lengths <- unlist(lapply(my.results, function (x) { length(unlist(x))}))
my.lengths
#[1]  2  6 20

# create a vector of values in all lists
my.values <- as.numeric(unlist(c(do.call(rbind, lapply(my.results, as.data.frame)))))
my.values
#[1]  2 13  2  4  6  9 11 13  1  1  2  3  3  4  5  5  6  7  7  8  9  9 10 11 11 12 13 13

my.matrix <- matrix(NA, nrow = max(my.lengths), ncol = length(my.lengths))

my.cumsum <- cumsum(my.lengths)

mm <- 1

for(i in 1:length(my.lengths)) {

     my.matrix[1:my.lengths[i],i] <- my.values[mm:my.cumsum[i]]

     mm <- my.cumsum[i]+1

}

my.df <- as.data.frame(my.matrix)
my.df
#   V1 V2 V3
#1   2  2  1
#2  13  4  1
#3  NA  6  2
#4  NA  9  3
#5  NA 11  3
#6  NA 13  4
#7  NA NA  5
#8  NA NA  5
#9  NA NA  6
#10 NA NA  7
#11 NA NA  7
#12 NA NA  8
#13 NA NA  9
#14 NA NA  9
#15 NA NA 10
#16 NA NA 11
#17 NA NA 11
#18 NA NA 12
#19 NA NA 13
#20 NA NA 13

尝试折叠::unlist2d ('unlist to data.frame'的简写):

l <- replicate(
  132,
  list(sample(letters, 20)),
  simplify = FALSE
)

library(collapse)
head(unlist2d(l))
  .id.1 .id.2 V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
1     1     1  e  x  b  d  s  p  a  c  k   z   q   m   u   l   h   n   r   t   o   y
2     2     1  r  t  i  k  m  b  h  n  s   e   p   f   o   c   x   l   g   v   a   j
3     3     1  t  r  v  z  a  u  c  o  w   f   m   b   d   g   p   q   y   e   n   k
4     4     1  x  i  e  p  f  d  q  k  h   b   j   s   z   a   t   v   y   l   m   n
5     5     1  d  z  k  y  a  p  b  h  c   v   f   m   u   l   n   q   e   i   w   j
6     6     1  l  f  s  u  o  v  p  z  q   e   r   c   h   n   a   t   m   k   y   x

head(unlist2d(l, idcols = FALSE))
  V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20
1  e  x  b  d  s  p  a  c  k   z   q   m   u   l   h   n   r   t   o   y
2  r  t  i  k  m  b  h  n  s   e   p   f   o   c   x   l   g   v   a   j
3  t  r  v  z  a  u  c  o  w   f   m   b   d   g   p   q   y   e   n   k
4  x  i  e  p  f  d  q  k  h   b   j   s   z   a   t   v   y   l   m   n
5  d  z  k  y  a  p  b  h  c   v   f   m   u   l   n   q   e   i   w   j
6  l  f  s  u  o  v  p  z  q   e   r   c   h   n   a   t   m   k   y   x