这里有另一种解决方法:

df1[~df1.index.isin(df1.merge(df2, how='inner', on=['col1', 'col2']).index)]

Or:

df1.loc[df1.index.difference(df1.merge(df2, how='inner', on=['col1', 'col2']).index)]

更容易，更简单，更优雅

uncommon_indices = np.setdiff1d(df1.index.values, df2.index.values)
new_df = df1.loc[uncommon_indices,:]

你可以使用isin(dict)方法:

In [74]: df1[~df1.isin(df2.to_dict('l')).all(1)]
Out[74]:
   col1  col2
3     4    13
4     5    14

解释:

In [75]: df2.to_dict('l')
Out[75]: {'col1': [1, 2, 3], 'col2': [10, 11, 12]}

In [76]: df1.isin(df2.to_dict('l'))
Out[76]:
    col1   col2
0   True   True
1   True   True
2   True   True
3  False  False
4  False  False

In [77]: df1.isin(df2.to_dict('l')).all(1)
Out[77]:
0     True
1     True
2     True
3    False
4    False
dtype: bool

pd。concat([df1, df2]).drop_duplicate (keep=False)将两个dataframe连接在一起，然后删除所有重复的数据，只保留唯一的行。默认情况下，它将保留第一次出现的副本，但设置keep=False将删除所有副本。

请记住，如果您需要比较具有不同名称的列的dataframe，那么在连接数据aframe之前，必须确保列具有相同的名称。

此外，如果数据框架的列顺序不同，也会影响最终结果。

一种方法是在两个dfs中存储一个内部合并表单的结果，然后我们可以简单地选择当一列的值不在这个公共值时的行:

In [119]:

common = df1.merge(df2,on=['col1','col2'])
print(common)
df1[(~df1.col1.isin(common.col1))&(~df1.col2.isin(common.col2))]
   col1  col2
0     1    10
1     2    11
2     3    12
Out[119]:
   col1  col2
3     4    13
4     5    14

EDIT

你已经发现的另一个方法是使用isin，它会生成NaN行，你可以删除:

In [138]:

df1[~df1.isin(df2)].dropna()
Out[138]:
   col1  col2
3     4    13
4     5    14

然而，如果df2不以同样的方式开始行，那么这将不起作用:

df2 = pd.DataFrame(data = {'col1' : [2, 3,4], 'col2' : [11, 12,13]})

将产生整个df:

In [140]:

df1[~df1.isin(df2)].dropna()
Out[140]:
   col1  col2
0     1    10
1     2    11
2     3    12
3     4    13
4     5    14

我认为那些包含合并的答案是极其缓慢的。因此，我建议另一种方法来获得两个数据框架之间不同的行:

df1 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3, 4, 5], 'col2' : [10, 11, 12, 13, 14]}) 
df2 = pandas.DataFrame(data = {'col1' : [1, 2, 3], 'col2' : [10, 11, 12]})

免责声明:如果您对两个数据框架不同的特定列感兴趣，那么我的解决方案是有效的。如果您只对那些所有列都相等的行感兴趣，则不要使用这种方法。

比方说，col1是一种ID，你只想获取那些不包含在两个数据框架中的行:

ids_in_df2 = df2.col1.unique()
not_found_ids = df[~df['col1'].isin(ids_in_df2 )]

就是这样。你得到的数据框架只包含那些col1在两个数据框架中都不明显的行。