我有一个名为spam的数据集,其中包含58列和约3500行与垃圾邮件相关的数据。
我计划将来在这个数据集上运行一些线性回归,但我想事先做一些预处理,并将列标准化,使其具有零平均值和单位方差。
有人告诉我,最好的方法是用R,所以我想问,如何用R实现归一化?我已经正确加载了数据,我只是在寻找一些包或方法来执行这个任务。
我有一个名为spam的数据集,其中包含58列和约3500行与垃圾邮件相关的数据。
我计划将来在这个数据集上运行一些线性回归,但我想事先做一些预处理,并将列标准化,使其具有零平均值和单位方差。
有人告诉我,最好的方法是用R,所以我想问,如何用R实现归一化?我已经正确加载了数据,我只是在寻找一些包或方法来执行这个任务。
当前回答
@BBKim给出了最好的答案,但它可以做得更短。我很惊讶居然还没人想到。
<- data.frame(x = rnorm(10,30, .2), y = runif(10,3,5)) 应用(dat, 2, function(x) (x - mean(x)) / sd(x))
其他回答
下面的代码可能是实现这一目标的最短方法。
dataframe <- apply(dataframe, 2, scale)
在我碰巧发现这条线索之前,我也有同样的问题。我有用户依赖的列类型,所以我写了一个for循环遍历它们并获得所需的列。也许有更好的方法,但这个方法很好地解决了问题:
for(i in 1:length(colnames(df))) {
if(class(df[,i]) == "numeric" || class(df[,i]) == "integer") {
df[,i] <- as.vector(scale(df[,i])) }
}
作为。向量是一个必要的部分,因为scale做rownames x 1矩阵这通常不是你想要的在data。frame中。
@BBKim给出了最好的答案,但它可以做得更短。我很惊讶居然还没人想到。
<- data.frame(x = rnorm(10,30, .2), y = runif(10,3,5)) 应用(dat, 2, function(x) (x - mean(x)) / sd(x))
意识到这个问题已经很老了,一个答案已经被接受了,我将提供另一个答案供参考。
缩放是有限的,因为它缩放所有变量。下面的解决方案只允许缩放特定的变量名,同时保持其他变量不变(变量名可以动态生成):
library(dplyr)
set.seed(1234)
dat <- data.frame(x = rnorm(10, 30, .2),
y = runif(10, 3, 5),
z = runif(10, 10, 20))
dat
dat2 <- dat %>% mutate_at(c("y", "z"), ~(scale(.) %>% as.vector))
dat2
这给了我这个:
> dat
x y z
1 29.75859 3.633225 14.56091
2 30.05549 3.605387 12.65187
3 30.21689 3.318092 13.04672
4 29.53086 3.079992 15.07307
5 30.08582 3.437599 11.81096
6 30.10121 4.621197 17.59671
7 29.88505 4.051395 12.01248
8 29.89067 4.829316 12.58810
9 29.88711 4.662690 19.92150
10 29.82199 3.091541 18.07352
and
> dat2 <- dat %>% mutate_at(c("y", "z"), ~(scale(.) %>% as.vector))
> dat2
x y z
1 29.75859 -0.3004815 -0.06016029
2 30.05549 -0.3423437 -0.72529604
3 30.21689 -0.7743696 -0.58772361
4 29.53086 -1.1324181 0.11828039
5 30.08582 -0.5946582 -1.01827752
6 30.10121 1.1852038 0.99754666
7 29.88505 0.3283513 -0.94806607
8 29.89067 1.4981677 -0.74751378
9 29.88711 1.2475998 1.80753470
10 29.82199 -1.1150515 1.16367556
编辑1(2016):处理朱利安的评论:规模的输出是Nx1矩阵,所以理想情况下,我们应该添加一个as。向量,将矩阵类型转换回向量类型。谢谢朱利安!
编辑2(2019):引用杜乔·A。对于最新的dplyr(0.8版本),您需要更改dplyr::funcs with list,如dat %>% mutate_each_(list(~scale(.) %>% as.vector), vars=c("y","z"))
EDIT 3(2020):感谢@mj_whales:旧的解决方案已弃用,现在我们需要使用mutate_at。
再说一次,尽管这是一个老问题,但它非常相关!我发现了一个简单的方法来规范化某些列,而不需要任何包:
normFunc <- function(x){(x-mean(x, na.rm = T))/sd(x, na.rm = T)}
例如
x<-rnorm(10,14,2)
y<-rnorm(10,7,3)
z<-rnorm(10,18,5)
df<-data.frame(x,y,z)
df[2:3] <- apply(df[2:3], 2, normFunc)
您将看到y和z列已经规范化。不需要软件包:-)