我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R,在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R,不管当前工作目录是什么。
换句话说,就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
我有一个名为foo的脚本。R包含另一个脚本other。R,在同一个目录下:
#!/usr/bin/env Rscript
message("Hello")
source("other.R")
但我想让R找到另一个。R,不管当前工作目录是什么。
换句话说,就是foo。R需要知道自己的路径。我该怎么做呢?
当前回答
我喜欢steamer25的解决方案,因为它似乎是最健壮的。然而,当在RStudio中调试时(在windows中),路径不会被正确设置。原因是,如果在RStudio中设置了断点,那么源文件将使用另一个“调试源”命令,该命令将脚本路径设置得稍微不同。下面是我目前正在使用的最终版本,它解释了调试时RStudio中的这种替代行为:
# @return full path to this script
get_script_path <- function() {
cmdArgs = commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle = "--file="
match = grep(needle, cmdArgs)
if (length(match) > 0) {
# Rscript
return(normalizePath(sub(needle, "", cmdArgs[match])))
} else {
ls_vars = ls(sys.frames()[[1]])
if ("fileName" %in% ls_vars) {
# Source'd via RStudio
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$fileName))
} else {
# Source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
}
}
}
其他回答
我已经将这个问题的答案打包并扩展为rprojroot中的新函数thisfile()。也适用于编织与针织。
#!/usr/bin/env Rscript
print("Hello")
# sad workaround but works :(
programDir <- dirname(sys.frame(1)$ofile)
source(paste(programDir,"other.R",sep='/'))
source(paste(programDir,"other-than-other.R",sep='/'))
我喜欢steamer25的解决方案,因为它似乎是最健壮的。然而,当在RStudio中调试时(在windows中),路径不会被正确设置。原因是,如果在RStudio中设置了断点,那么源文件将使用另一个“调试源”命令,该命令将脚本路径设置得稍微不同。下面是我目前正在使用的最终版本,它解释了调试时RStudio中的这种替代行为:
# @return full path to this script
get_script_path <- function() {
cmdArgs = commandArgs(trailingOnly = FALSE)
needle = "--file="
match = grep(needle, cmdArgs)
if (length(match) > 0) {
# Rscript
return(normalizePath(sub(needle, "", cmdArgs[match])))
} else {
ls_vars = ls(sys.frames()[[1]])
if ("fileName" %in% ls_vars) {
# Source'd via RStudio
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$fileName))
} else {
# Source'd via R console
return(normalizePath(sys.frames()[[1]]$ofile))
}
}
}
解决方案在2016年出现。非常感谢作者,Sahil Seth!
CRAN和github上的funr包提供了sys.script()函数,该函数获取当前脚本的完整路径。它甚至引用了一个类似的SO帖子。
因此,解是:
myscript。接待员:
#!/usr/bin/env Rscript
f <- funr::sys.script()
show(f)
然后执行命令:
user@somewhere:/home$ Rscript myscript.R
将在命令行输出,例如:
"/home/path/to/myscript.R"
到控制台。
我也有这个问题,上面的解决方案都不适合我。也许是来源之类的,但还不够清楚。
我找到了这个,对我来说很优雅的解决方案:
paste0(gsub("\\", "/", fileSnapshot()$path, fixed=TRUE),"/")
其中重要的是fileSnapshot(),它提供了关于文件的大量信息。它返回一个包含8个元素的列表。当您选择path作为列表元素时,路径将以\\作为分隔符返回,因此其余代码只是更改这一点。
我希望这能有所帮助。