相信一个图可以简单地表示为:

class Node {
   int value;
   List<Node> adj;
}

实现大部分你自己感兴趣的算法。如果您在一些关于图形的练习/学习过程中遇到了这个问题，那么这是最好的库。,)

对于大多数常见算法，你也可以选择邻接矩阵:

class SparseGraph {
  int[] nodeValues;
  List<Integer>[] edges;     
}

或者一些运算的矩阵:

class DenseGraph {
  int[] nodeValues;
  int[][] edges;     
}

在一个大学项目中，我摆弄了yWorks的yFiles，发现它有很好的API。

如果你实际上是在寻找图表库，而不是节点/边缘图库，我建议你挥霍大无面图库(BFG)。它比JFreeChart更容易使用，看起来更好，运行更快，有更多的输出选项，真的没有可比性。

查看蓝图:

蓝图是属性图数据模型的接口、实现、实现和测试套件的集合。蓝图类似于JDBC，但用于图形数据库。在TinkerPop开源软件堆栈中，蓝图作为基础技术用于:

管道:一个惰性的数据流框架

Gremlin:一种图遍历语言

框架:对象到图的映射器

熔炉:一个图形算法包

Rexster:图形服务器

http://incubator.apache.org/hama/是Hadoop上用于大量矩阵和图形数据的分布式科学软件包。

如果你喜欢图形算法，JDSL (Java中的数据结构库)应该足够好了——http://www.cs.brown.edu/cgc/jdsl/