我该如何处理“package 'xxx' is not available (for R version x.y.z)”警告?

我试着安装一个包，使用

install.packages("foobarbaz")

却收到了警告

Warning message:
package 'foobarbaz' is not available (for R version x.y.z)

为什么R认为这个包是不可用的?

参见这些问题的具体例子:

My package doesn't work for R 2.15.2 package 'Rbbg' is not available (for R version 2.15.2) package is not available (for R version 2.15.2) package doMC NOT available for R version 3.0.0 warning in install.packages Dependency ‘Rglpk’ is not available for package ‘fPortfolio’ What to do when a package is not available for our R version? Is the bigvis package for R not available for R version 3.0.1? package ‘syncwave’/‘mvcwt’ is not available (for R version 3.0.2) package ‘diamonds’ is not available (for R version 3.0.0) Is the plyr package for R not available for R version 3.0.2? Package bigmemory not installing on R 64 3.0.2 package "makeR" is not available (for version 3.0.2) package ‘RTN’ is not available (for R version 3.0.1) Trouble Installing geoR package package ‘twitterR’ is not available (for R version 3.1.0) How to install 'Rcpp, package? I got "package is not available" package ‘dataset’ is not available (for R version 3.1.1) "package ‘rhipe’ is not available (for R version 3.1.2)"

当前回答

1. 你不会拼写

要测试的第一件事是您是否正确拼写了包的名称?包名在R中区分大小写。

2. 你没有找对仓库

接下来，您应该检查该包是否可用。类型

setRepositories()

参见? setrepository。

查看R将在哪些存储库中查找您的包，并可选地选择一些其他存储库。至少，您通常会希望选择CRAN，如果使用Windows则选择CRAN(附加)，如果进行任何生物学分析则选择Bioc*存储库。

要永久地改变这一点，可以在Rprofile中添加setrepos(ind = c(1:6, 8))这样的行。网站文件。

3.软件包不在您选择的存储库中

返回所有可用的包

ap <- available.packages()

请参见R的可用包的名称，?available.packages。

由于这是一个很大的矩阵，您可能希望使用数据查看器来检查它。或者，您也可以通过测试行名来快速检查包是否可用。

View(ap)
"foobarbaz" %in% rownames(ap)

或者，可用软件包的列表可以在浏览器中查看CRAN、CRAN (extras)、Bioconductor、R-forge、RForge和GitHub。

当与CRAN镜像交互时，您可能会收到的另一个警告消息是:

Warning: unable to access index for repository

这可能表明所选的CRAN存储库当前不可用。您可以使用chooseCRANmirror()选择不同的镜像，并再次尝试安装。

有几个原因可能导致包不可用。

4. 你不想要包裹

也许你并不是真的想要一个包裹。对于包和库，或者包和数据集之间的区别感到困惑是很常见的。

包是扩展R语言的标准化材料集合，例如提供代码、数据或文档。库是一个R可以找到它可以使用的包的位置(目录)

要查看可用的数据集，请键入

data()

5. R或Bioconductor已经过时了

它可能依赖于R的最新版本(或者它导入/依赖的某个包)。看看

ap["foobarbaz", "Depends"]

并考虑将R安装更新到当前版本。在Windows上，这最容易通过安装包完成。

library(installr)
updateR()

(当然，你可能需要先安装install.packages("installr")。)

对于Bioconductor包，您可能需要更新Bioconductor安装。

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BiocUpgrade")

6. 包装过期了

它可能已经存档(如果不再维护它并且不再通过R CMD检查测试)。

在这种情况下，您可以使用install_version()加载包的旧版本。

library(remotes)
install_version("foobarbaz", "0.1.2")

另一种方法是从GitHub CRAN镜像安装。

library(remotes)
install_github("cran/foobarbaz")

7. 没有Windows/OS X/Linux二进制文件

它可能没有Windows二进制文件，因为需要CRAN没有的附加软件。此外，有些包只能通过某些或所有平台的源代码获得。在这种情况下，CRAN (extras)存储库中可能有一个版本(参见上面的setrepository)。

如果包需要编译代码(例如C, c++， FORTRAN)，那么在Windows上安装Rtools或在OS X上安装XCode附带的开发人员工具，并通过以下方式安装包的源版本:

install.packages("foobarbaz", type = "source")

# Or equivalently, for Bioconductor packages:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("foobarbaz", type = "source")

在CRAN上，您可以通过查看描述中的NeedsCompilation标志来判断是否需要特殊的工具从源代码构建包。

8. 该软件包在GitHub/Bitbucket/Gitorious上

它可能在GitHub/Bitbucket/Gitorious上有一个存储库。这些包需要安装remotes包。

library(remotes)
install_github("packageauthor/foobarbaz")
install_bitbucket("packageauthor/foobarbaz")
install_gitorious("packageauthor/foobarbaz")

(和installr一样，你可能需要先安装.packages("remotes")。)

9. 该包没有源版本

虽然包的二进制版本可用，但源版本不可用。您可以通过设置关闭此检查

options(install.packages.check.source = "no")

如imanuelc和?install.packages的详细信息部分所述。

10. 包位于非标准存储库中

你的包在一个非标准的存储库中(例如Rbbg)。假设它与CRAN标准合理兼容，您仍然可以使用install.packages下载它;你只需要指定存储库URL。

install.packages("Rbbg", repos = "http://r.findata.org")

另一方面，RHIPE并不在类似于crane的存储库中，它有自己的安装说明。

2014-09-08 10:11:56

其他回答

当从源代码安装R包时，我犯了一个错误，忘记把repos=NULL。在这种情况下，错误消息有点误导:包'foobarbaz'不可用(对于R版本x.y.z)

问题不在于R的版本，而在于回购参数。我安装了。packages('path/to/source/code/of/foobarbaz'， type='source'， repos=NULL)在这种情况下为我工作。

希望这能帮助到一些人。

2018-06-25 17:45:03