另一个原因+解决方案

当我试图在我公司的HPC上的RStudio中安装pkgdown时，我遇到了这个错误(“包XXX对于R版本X.X.X不可用”)。

事实证明，他们在HPC上拥有的CRAN快照是2018年1月(几乎2年前)的，而且pkgdown当时确实不存在。这意味着为外行用户控制包的源代码，但作为开发人员，在大多数情况下，您可以通过以下方式更改:

## checking the specific repos you currently have
getOption("repos")

## updating your CRAN snapshot to a newer date
r <- getOption("repos")
r["newCRAN"] <- "https://cran.microsoft.com/snapshot/*2019-11-07*/"
options(repos = r)

## add newCRAN to repos you can use
setRepositories()

如果您知道您在做什么，并且可能需要多个在您的系统的CRAN中不可用的包，您可以在您的项目. rprofile中进行设置。

如果只有一个包，可能只使用install。包(“包名”，repos =“一个比你公司的旧的CRAN快照更新的CRAN”)。

1. 你不会拼写

要测试的第一件事是您是否正确拼写了包的名称?包名在R中区分大小写。

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2. 你没有找对仓库

接下来，您应该检查该包是否可用。类型

setRepositories()

参见? setrepository。

查看R将在哪些存储库中查找您的包，并可选地选择一些其他存储库。至少，您通常会希望选择CRAN，如果使用Windows则选择CRAN(附加)，如果进行任何生物学分析则选择Bioc*存储库。

要永久地改变这一点，可以在Rprofile中添加setrepos(ind = c(1:6, 8))这样的行。网站文件。

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3.软件包不在您选择的存储库中

返回所有可用的包

ap <- available.packages()

请参见R的可用包的名称，?available.packages。

由于这是一个很大的矩阵，您可能希望使用数据查看器来检查它。或者，您也可以通过测试行名来快速检查包是否可用。

View(ap)
"foobarbaz" %in% rownames(ap)

或者，可用软件包的列表可以在浏览器中查看CRAN、CRAN (extras)、Bioconductor、R-forge、RForge和GitHub。

当与CRAN镜像交互时，您可能会收到的另一个警告消息是:

Warning: unable to access index for repository

这可能表明所选的CRAN存储库当前不可用。您可以使用chooseCRANmirror()选择不同的镜像，并再次尝试安装。

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有几个原因可能导致包不可用。

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4. 你不想要包裹

也许你并不是真的想要一个包裹。对于包和库，或者包和数据集之间的区别感到困惑是很常见的。

包是扩展R语言的标准化材料集合，例如提供代码、数据或文档。库是一个R可以找到它可以使用的包的位置(目录)

要查看可用的数据集，请键入

data()

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5. R或Bioconductor已经过时了

它可能依赖于R的最新版本(或者它导入/依赖的某个包)。看看

ap["foobarbaz", "Depends"]

并考虑将R安装更新到当前版本。在Windows上，这最容易通过安装包完成。

library(installr)
updateR()

(当然，你可能需要先安装install.packages("installr")。)

对于Bioconductor包，您可能需要更新Bioconductor安装。

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BiocUpgrade")

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6. 包装过期了

它可能已经存档(如果不再维护它并且不再通过R CMD检查测试)。

在这种情况下，您可以使用install_version()加载包的旧版本。

library(remotes)
install_version("foobarbaz", "0.1.2")

另一种方法是从GitHub CRAN镜像安装。

library(remotes)
install_github("cran/foobarbaz")

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7. 没有Windows/OS X/Linux二进制文件

它可能没有Windows二进制文件，因为需要CRAN没有的附加软件。此外，有些包只能通过某些或所有平台的源代码获得。在这种情况下，CRAN (extras)存储库中可能有一个版本(参见上面的setrepository)。

如果包需要编译代码(例如C, c++， FORTRAN)，那么在Windows上安装Rtools或在OS X上安装XCode附带的开发人员工具，并通过以下方式安装包的源版本:

install.packages("foobarbaz", type = "source")

# Or equivalently, for Bioconductor packages:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("foobarbaz", type = "source")

在CRAN上，您可以通过查看描述中的NeedsCompilation标志来判断是否需要特殊的工具从源代码构建包。

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8. 该软件包在GitHub/Bitbucket/Gitorious上

它可能在GitHub/Bitbucket/Gitorious上有一个存储库。这些包需要安装remotes包。

library(remotes)
install_github("packageauthor/foobarbaz")
install_bitbucket("packageauthor/foobarbaz")
install_gitorious("packageauthor/foobarbaz")

(和installr一样，你可能需要先安装.packages("remotes")。)

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9. 该包没有源版本

虽然包的二进制版本可用，但源版本不可用。您可以通过设置关闭此检查

options(install.packages.check.source = "no")

如imanuelc和?install.packages的详细信息部分所述。

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10. 包位于非标准存储库中

你的包在一个非标准的存储库中(例如Rbbg)。假设它与CRAN标准合理兼容，您仍然可以使用install.packages下载它;你只需要指定存储库URL。

install.packages("Rbbg", repos = "http://r.findata.org")

另一方面，RHIPE并不在类似于crane的存储库中，它有自己的安装说明。

这个解决方案可能会破坏R，但这里有一个最简单的解决方案，99%的时间都有效。

你需要做的只是:

install.packages('package-name',repos='http://cran.us.r-project.org')

正如作者在这里提到的

11. R(或其他依赖项)已经过期，您不想更新它。

警告:这并不是最佳实践。

下载包源代码。 导航到DESCRIPTION文件。 用你的文本编辑器删除恼人的行。 取决于:R (>= 3.1.1) 从本地安装(即从DESCRIPTION的父目录安装)。 安装。packages("foo"， type="source"， repos=NULL)

我也有同样的问题(在Linux上)，可以通过更改代理设置来解决。 如果您在代理服务器后面，请使用R. getenv("http_proxy")检查配置。 在我的~/。我有以下几行(来自https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200488488-Configuring-R-to-Use-an-HTTP-or-HTTPS-Proxy)导致了这个问题:

http_proxy=https://proxy.dom.com:port
http_proxy_user=user:passwd

改为

http_proxy="http://user:passwd@proxy.dom.com:port"

解决了问题。你可以对https做同样的事情。

当我读到“包xxx不可用于r版本-x-y-z”时，我的第一个想法不是……

HTH

另一个小的添加，当尝试使用docker映像摇杆/ R -ver:3.1.0测试旧R版本时

默认的回购设置是MRAN，这无法获得许多包。 那个版本的R没有https，所以，举个例子: 安装。Packages ("knitr"， repos = "https://cran.rstudio.com")似乎可以工作。