在我的例子中，它是目录结构。 我的项目是这样的:

+---dir_A
    +---dir_B
        +app
        |
        \-run.py

右键点击dir_b >将目录标记为>项目根目录

德米特里的回答对我不起作用。

我打开Project Interpreters，选择“Paths”选项卡，然后点击子菜单中的刷新按钮。它自动填充了一种叫做“蟒蛇骨架”的东西。

编辑:使用PyCharm 3.4.1截图(它隐藏得很好)

当失效缓存或刷新路径不起作用时，我发现自己删除并重新添加远程解释器来修复这个问题。

我使用vagrant，每隔一段时间，如果我添加一个新的虚拟机到我的多虚拟机设置，转发的端口改变，这似乎使PyCharm混淆，当它试图使用错误的SSH端口时。更改端口似乎并不能帮助损坏的引用。

在我的例子中，它是目录结构。 我的项目是这样的:

+---dir_A
    +---dir_B
        +app
        |
        \-run.py

右键点击dir_b >将目录标记为>项目根目录

我必须去文件->无效缓存/重新启动，重新启动Ubuntu 18.04 LTS，然后打开Pycharm和文件->无效缓存/重新启动，然后才清理。

以上的方法对我都没用! 如果您正在为项目使用虚拟环境，请确保应用虚拟环境目录中的python.exe文件作为项目的解释器(Alt + Ctrl + Shift + S) 这为我解决了问题。