我的大部分个人函数和加载的库都在rfunction中。r脚本

source("c:\\data\\rprojects\\functions\\Rfunctions.r")


.First <- function(){
   cat("\n Rrrr! The statistics program for Pirates !\n\n")

  }

  .Last <- function(){
   cat("\n Rrrr! Avast Ye, YO HO!\n\n")

  }


#===============================================================
# Tinn-R: necessary packages
#===============================================================
library(utils)
necessary = c('svIDE', 'svIO', 'svSocket', 'R2HTML')
if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package']))
  install.packages(c('SciViews', 'R2HTML'), dep = T)

options(IDE = 'C:/Tinn-R/bin/Tinn-R.exe')
options(use.DDE = T)

library(svIDE)
library(svIO)
library(svSocket)
library(R2HTML)
guiDDEInstall()
shell(paste("mkdir C:\\data\\rplots\\plottemp", gsub('-','',Sys.Date()), sep=""))
pldir <- paste("C:\\data\\rplots\\plottemp", gsub('-','',Sys.Date()), sep="")

plot.str <-c('savePlot(paste(pldir,script,"\\BeachSurveyFreq.pdf",sep=""),type="pdf")')

我的包括选项(menu.graphics=FALSE)，因为我喜欢禁用/抑制tcltk弹出的CRAN镜像在R中选择。

这是我的。它不会帮助你着色，但我从ESS和Emacs…

options("width"=160)                # wide display with multiple monitors
options("digits.secs"=3)            # show sub-second time stamps

r <- getOption("repos")             # hard code the US repo for CRAN
r["CRAN"] <- "http://cran.us.r-project.org"
options(repos = r)
rm(r)

## put something this is your .Rprofile to customize the defaults
setHook(packageEvent("grDevices", "onLoad"),
        function(...) grDevices::X11.options(width=8, height=8, 
                                             xpos=0, pointsize=10, 
                                             #type="nbcairo"))  # Cairo device
                                             #type="cairo"))    # other Cairo dev
                                             type="xlib"))      # old default

## from the AER book by Zeileis and Kleiber
options(prompt="R> ", digits=4, show.signif.stars=FALSE)


options("pdfviewer"="okular")         # on Linux, use okular as the pdf viewer

我在个人资料中设置了格子颜色主题。以下是我使用的另外两个调整方法:

# Display working directory in the titlebar
# Note: This causes demo(graphics) to fail
utils::setWindowTitle(base::getwd())
utils::assignInNamespace("setwd",function(dir)   {.Internal(setwd(dir));setWindowTitle(base::getwd())},"base")

# Don't print more than 1000 lines
options(max.print=2000)

这是我的~/。Rprofile，为Mac和Linux设计。

这使得错误更容易被发现。

options(showWarnCalls=T, showErrorCalls=T)

我讨厌CRAN菜单选择，所以设置一个好的。

options(repos=c("http://cran.cnr.Berkeley.edu","http://cran.stat.ucla.edu"))

更多的历史!

Sys.setenv(R_HISTSIZE='100000')

下面是从终端在Mac OSX上运行的(我更喜欢R.app，因为它更稳定，你可以通过目录来组织你的工作;还要确保得到一个好的~/.inputrc)。默认情况下，你会得到一个X11显示，这看起来不太好;这反而给出了一个与GUI相同的石英显示。if语句应该在Mac上从终端运行R时捕获这种情况。

f = pipe("uname")
if (.Platform$GUI == "X11" && readLines(f)=="Darwin") {
  # http://www.rforge.net/CarbonEL/
  library("grDevices")
  library("CarbonEL")
  options(device='quartz')
  Sys.unsetenv("DISPLAY")
}
close(f); rm(f)

并预加载一些库，

library(plyr)
library(stringr)
library(RColorBrewer)
if (file.exists("~/util.r")) {
  source("~/util.r")
}

跑龙套的地方。r是我在通量下随机选取的一袋东西。

此外，由于其他人提到了控制台宽度，以下是我如何做到这一点。

if ( (numcol <-Sys.getenv("COLUMNS")) != "") {
  numcol = as.integer(numcol)
  options(width= numcol - 1)
} else if (system("stty -a &>/dev/null") == 0) {
  # mac specific?  probably bad in the R GUI too.
  numcol = as.integer(sub(".* ([0-9]+) column.*", "\\1", system("stty -a", intern=T)[1]))
  if (numcol > 0)
    options(width=  numcol - 1 )
}
rm(numcol)

这实际上不在. rprofile中，因为每次调整终端窗口大小时都必须重新运行它。我有它在util。r那么我只是在必要的时候引用它。

下面是将表导出到LaTeX的一小段代码。它将我编写的许多报告的所有列名更改为数学模式。我的. r配置文件的其余部分是相当标准的，上面已经介绍了大部分内容。

# Puts $dollar signs in front and behind all column names col_{sub} -> $col_{sub}$

amscols<-function(x){
    colnames(x) <- paste("$", colnames(x), "$", sep = "")
    x
}