options(stringsAsFactors=FALSE)

虽然我的. r配置文件中没有这个，因为它可能会破坏我的合作者的代码，但我希望它是默认的。为什么?

1)字符向量使用更少的内存(但只是很少);

2)更重要的是，我们可以避免这样的问题:

> x <- factor(c("a","b","c"))
> x
[1] a b c
Levels: a b c
> x <- c(x, "d")
> x
[1] "1" "2" "3" "d"

and

> x <- factor(c("a","b","c"))
> x[1:2] <- c("c", "d")
Warning message:
In `[<-.factor`(`*tmp*`, 1:2, value = c("c", "d")) :
  invalid factor level, NAs generated

因子在你需要的时候很有用(比如在图中实现排序)，但大多数时候都很麻烦。

我讨厌每次都输入“头”、“摘要”、“名字”这些完整的单词，所以我用别名。

你可以在你的. rprofile文件中放入别名，但是你必须使用函数的完整路径(例如utils::head)，否则它将无法工作。

# aliases
s <- base::summary
h <- utils::head
n <- base::names

编辑:回答你的问题，你可以使用显色包在终端中有不同的颜色。太酷了!: -)

这是我的。它不会帮助你着色，但我从ESS和Emacs…

options("width"=160)                # wide display with multiple monitors
options("digits.secs"=3)            # show sub-second time stamps

r <- getOption("repos")             # hard code the US repo for CRAN
r["CRAN"] <- "http://cran.us.r-project.org"
options(repos = r)
rm(r)

## put something this is your .Rprofile to customize the defaults
setHook(packageEvent("grDevices", "onLoad"),
        function(...) grDevices::X11.options(width=8, height=8, 
                                             xpos=0, pointsize=10, 
                                             #type="nbcairo"))  # Cairo device
                                             #type="cairo"))    # other Cairo dev
                                             type="xlib"))      # old default

## from the AER book by Zeileis and Kleiber
options(prompt="R> ", digits=4, show.signif.stars=FALSE)


options("pdfviewer"="okular")         # on Linux, use okular as the pdf viewer

我喜欢保存我的R命令历史，并在每次运行R命令时都可用:

在shell或.bashrc中:

export R_HISTFILE=~/.Rhistory

在.Rprofile:

.Last <- function() {
        if (!any(commandArgs()=='--no-readline') && interactive()){
                require(utils)
                try(savehistory(Sys.getenv("R_HISTFILE")))
        }
}

我发现两个函数是非常必要的:首先，当我在几个函数上设置debug()并且我已经解决了错误，所以我想要undebug()所有函数-而不是一个接一个。在这里添加的undebug_all()函数作为接受的答案是最好的。

其次，当我定义了许多函数并正在寻找一个特定的变量名时，很难在ls()的所有结果中找到它，包括函数名。这里发布的lsnofun()函数真的很好。

我的大部分个人函数和加载的库都在rfunction中。r脚本

source("c:\\data\\rprojects\\functions\\Rfunctions.r")


.First <- function(){
   cat("\n Rrrr! The statistics program for Pirates !\n\n")

  }

  .Last <- function(){
   cat("\n Rrrr! Avast Ye, YO HO!\n\n")

  }


#===============================================================
# Tinn-R: necessary packages
#===============================================================
library(utils)
necessary = c('svIDE', 'svIO', 'svSocket', 'R2HTML')
if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package']))
  install.packages(c('SciViews', 'R2HTML'), dep = T)

options(IDE = 'C:/Tinn-R/bin/Tinn-R.exe')
options(use.DDE = T)

library(svIDE)
library(svIO)
library(svSocket)
library(R2HTML)
guiDDEInstall()
shell(paste("mkdir C:\\data\\rplots\\plottemp", gsub('-','',Sys.Date()), sep=""))
pldir <- paste("C:\\data\\rplots\\plottemp", gsub('-','',Sys.Date()), sep="")

plot.str <-c('savePlot(paste(pldir,script,"\\BeachSurveyFreq.pdf",sep=""),type="pdf")')