对于复杂的项目，有一个单独的模块管理文件可能很有用，它控制组和子组。整个层次结构可以在一个地方，然后每个文件可以简单地填充到子组中。例如:

/**
 * @defgroup example Top Level Example Group
 * @brief    The Example module.
 *
 * @{
 */

/**
 * @defgroup example_child1 First Child of Example
 * @brief    1st of 2 example children.
 */

/**
 * @defgroup example_child2 Second Child of Example
 * @brief    2nd of 2 example children.
 */

// @}

简单地在另一个组的{}中包含一个组的定义，使其成为该组的子组。然后在代码和头文件中，函数可以被标记为它们所在的任何组的一部分，这一切都可以在完成的文档中工作。它使得重构文档以匹配重构代码更加容易。

不要用@author或@date (@date在另一篇文章中提到过)。这些都是由修订控制系统处理的。

我使用一个subversion post-commit钩子来提取已经更改的目录，将它们写入一个文件，然后每天晚上我自动在我们的web服务器上重新生成doxygen html，这样我们总是有最新的docco。

我想要记录的每个项目都有一个小项目。Doxy文件，包含每个项目的设置和一个包含到主doxygen设置-例如:

PROJECT_NAME           = "AlertServer"
PROJECT_NUMBER         = 8.1.2
INPUT                  = "C:/Dev/src/8.1.2/Common/AlertServer"
HTML_OUTPUT            = "AlertServer"
@INCLUDE = "c:\dev\CommonConfig.doxy"

对于Windows SVN服务器，使用钩子:

@echo off
for /F "eol=¬ delims=¬" %%A in ('svnlook dirs-changed %1 -r %2') do echo %%A >> c:\svn_exports\export.txt

然后每晚运行:

@echo off

rem ---------------
rem remove duplicates.
type nul> %TEMP%.\TEMP.txt

for /F "eol=¬ delims=¬" %%a in (c:\svn_exports\export.txt) do (
 findstr /L /C:"%%a" < %TEMP%.\TEMP.txt > nul
 if errorlevel=1 echo %%a>> %TEMP%.\TEMP.txt
)

copy /y %TEMP%.\TEMP.txt export_uniq.cmd >nul
if exist %TEMP%.\TEMP.txt del %TEMP%.\TEMP.txt


rem ---------------
rem fetch all the recently changed directories into the svn_exports directory

for /F "eol=¬ delims=¬" %%A in (c:\svn_exports\export_uniq.cmd) do (
  svn export "file:///d:/repos/MyRepo/%%A" "c:/svn_exports/%%A"  --force 
)


rem ---------------
rem search through all dirs for any config files, if found run doxygen

for /R c:\svn_exports %%i in (*.doxy) do c:\tools\doxygen\bin\doxygen.exe "%i"


rem ---------------
rem now remove the directories to be generated.
del /F c:\svn_exports

这将删除重复的条目，找到具有.doxy项目文件的所有项目，并在它们上运行doxygen。瞧:在web服务器上有完整的文档，总是最新的代码。

尽可能多地使用例子。它自动将API元素链接到示例代码。

使用组将代码组织成模块。

请记住，您可以将几乎所有内容放到多个组中，以便它们可以用于提供语义标记，就像Stack Overflow中的标记一样。例如，可以将内容标记为特定于给定平台的内容。

您还可以使用组来匹配IDE中的文件夹层次结构，如我的RB2Doxy示例输出所示。

组在嵌套时工作得很好——我有一个OOFILE源代码的大示例。

使用了大量的链接。这可以使用see also链接(如果您喜欢，可以使用\see或@see)来完成，并确保在文档中使用正确的类名引用其他类名。例如，如果你将FUZZYObject类引用为一个“对象”，那么在它后面立即写上类的名称(例如:“疲惫的对象(FUZZYObject)”)。