一般来说,有没有一种有效的方法可以知道Python中的迭代器中有多少个元素,而不用遍历每个元素并计数?
当前回答
关于你最初的问题,答案仍然是,在Python中通常没有办法知道迭代器的长度。
Given that you question is motivated by an application of the pysam library, I can give a more specific answer: I'm a contributer to PySAM and the definitive answer is that SAM/BAM files do not provide an exact count of aligned reads. Nor is this information easily available from a BAM index file. The best one can do is to estimate the approximate number of alignments by using the location of the file pointer after reading a number of alignments and extrapolating based on the total size of the file. This is enough to implement a progress bar, but not a method of counting alignments in constant time.
其他回答
不,任何方法都需要解析每个结果。你可以这样做
iter_length = len(list(iterable))
但是在无限迭代器上运行它当然不会返回。它还将消耗迭代器,如果你想使用内容,它将需要重置。
告诉我们你想要解决的真正问题可能会帮助我们找到更好的方法来实现你的实际目标。
编辑:使用list()会将整个可迭代对象一次性读入内存,这可能是不可取的。另一种方法是做
sum(1 for _ in iterable)
正如另一个人发布的那样。这样可以避免把它保存在记忆中。
虽然一般情况下不可能按照要求去做,但在迭代了多少项之后,对它们进行迭代的次数进行计数通常仍然是有用的。为此,您可以使用jaraco.itertools.Counter或类似的方法。下面是一个使用python3和rwt加载包的例子。
$ rwt -q jaraco.itertools -- -q
>>> import jaraco.itertools
>>> items = jaraco.itertools.Counter(range(100))
>>> _ = list(counted)
>>> items.count
100
>>> import random
>>> def gen(n):
... for i in range(n):
... if random.randint(0, 1) == 0:
... yield i
...
>>> items = jaraco.itertools.Counter(gen(100))
>>> _ = list(counted)
>>> items.count
48
不能(除非特定迭代器的类型实现了一些特定的方法,使之成为可能)。
通常,只能通过使用迭代器来计数迭代器项。最有效的方法之一:
import itertools
from collections import deque
def count_iter_items(iterable):
"""
Consume an iterable not reading it into memory; return the number of items.
"""
counter = itertools.count()
deque(itertools.izip(iterable, counter), maxlen=0) # (consume at C speed)
return next(counter)
(对于Python 3。X替换itertools。Izip with zip)。
所以,对于那些想知道讨论总结的人。使用以下方法计算5000万长度生成器表达式的最终最高分:
len(列表(创)), Len ([_ for _ in gen]), Sum (1 for _ in gen), Ilen (gen) (from more_itertool), Reduce (c, i: c + 1, gen, 0),
按执行性能排序(包括内存消耗),会让你大吃一惊:
```
1: test_list.py: 8:0.492 KiB
gen = (i for i in data*1000); t0 = monotonic(); len(list(gen))
('list, sec', 1.9684218849870376)
2: test_list_compr.py: 8:0.867 KiB
gen = (i for i in data*1000); t0 = monotonic(); len([i for i in gen])
('list_compr, sec', 2.5885991149989422)
3: test_sum.py:8: 0.859 KiB
gen = (i for i in data*1000); t0 = monotonic(); sum(1 for i in gen); t1 = monotonic()
('sum, sec', 3.441088170016883)
4: more_itertools/more.py:413: 1.266 KiB
d = deque(enumerate(iterable, 1), maxlen=1)
test_ilen.py:10: 0.875 KiB
gen = (i for i in data*1000); t0 = monotonic(); ilen(gen)
(ilen, sec, 9.812256851990242)
5: test_reduce.py:8: 0.859 KiB
gen = (i for i in data*1000); t0 = monotonic(); reduce(lambda counter, i: counter + 1, gen, 0)
('reduce, sec', 13.436614598002052) ' ' '
因此,len(list(gen))是使用频率最高且占用内存较少的
这段代码应该工作:
>>> iter = (i for i in range(50))
>>> sum(1 for _ in iter)
50
尽管它确实遍历每一项并计算它们,但这是最快的方法。
它也适用于迭代器中没有项的情况:
>>> sum(1 for _ in range(0))
0
当然,对于一个无限的输入,它会一直运行,所以请记住迭代器可以是无限的:
>>> sum(1 for _ in itertools.count())
[nothing happens, forever]
此外,请注意,这样做将耗尽迭代器,并且进一步尝试使用它将看不到任何元素。这是Python迭代器设计的一个不可避免的结果。如果你想保留元素,你就必须把它们存储在一个列表或其他东西中。
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