我试图使用scikit-learn的LabelEncoder来编码字符串标签的pandas DataFrame。由于数据帧有许多(50+)列,我想避免为每一列创建一个LabelEncoder对象;我宁愿只有一个大的LabelEncoder对象,它可以跨所有数据列工作。

将整个DataFrame扔到LabelEncoder中会产生以下错误。请记住,我在这里使用的是虚拟数据;实际上,我正在处理大约50列的字符串标记数据,所以需要一个解决方案,不引用任何列的名称。

import pandas
from sklearn import preprocessing 

df = pandas.DataFrame({
    'pets': ['cat', 'dog', 'cat', 'monkey', 'dog', 'dog'], 
    'owner': ['Champ', 'Ron', 'Brick', 'Champ', 'Veronica', 'Ron'], 
    'location': ['San_Diego', 'New_York', 'New_York', 'San_Diego', 'San_Diego', 
                 'New_York']
})

le = preprocessing.LabelEncoder()

le.fit(df)

回溯(最近一次调用): 文件“”,第1行,在 文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/预处理/label.py",第103行 y = column_or_1d(y, warn=True) 文件"/Users/bbalin/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/utils/validation.py",第306行,在column_or_1d中 raise ValueError("错误的输入形状{0}".format(形状)) ValueError:错误的输入形状(6,3)

对于如何解决这个问题有什么想法吗?


当前回答

使用Neuraxle

TLDR;你可以在这里使用flatforeach包装类简单地转换你的df,如:

使用这种方法,您的标签编码器将能够在常规的scikit-learn Pipeline中适应和转换。让我们简单地导入:

from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from neuraxle.steps.column_transformer import ColumnTransformer
from neuraxle.steps.loop import FlattenForEach

列的共享编码器相同:

下面是一个共享的LabelEncoder将如何应用于所有数据来编码:

    p = FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)

结果:

    p, predicted_output = p.fit_transform(df.values)
    expected_output = np.array([
        [6, 7, 6, 8, 7, 7],
        [1, 3, 0, 1, 5, 3],
        [4, 2, 2, 4, 4, 2]
    ]).transpose()
    assert np.array_equal(predicted_output, expected_output)

每列不同的编码器:

这里是第一个独立的LabelEncoder将如何应用于宠物,第二个将为列的所有者和位置共享。所以准确地说,我们这里有一个不同的和共享的标签编码器的组合:

    p = ColumnTransformer([
        # A different encoder will be used for column 0 with name "pets":
        (0, FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)),
        # A shared encoder will be used for column 1 and 2, "owner" and "location":
        ([1, 2], FlattenForEach(LabelEncoder(), then_unflatten=True)),
    ], n_dimension=2)

结果:

    p, predicted_output = p.fit_transform(df.values)
    expected_output = np.array([
        [0, 1, 0, 2, 1, 1],
        [1, 3, 0, 1, 5, 3],
        [4, 2, 2, 4, 4, 2]
    ]).transpose()
    assert np.array_equal(predicted_output, expected_output)

其他回答

在这里和其他地方进行了大量的搜索和实验后,我认为你的答案是:

pd.DataFrame(列= df.columns, data = LabelEncoder () .fit_transform (df.values.flatten ()) .reshape (df.shape))

这将跨列保留类别名称:

import pandas as pd
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder

df = pd.DataFrame([['A','B','C','D','E','F','G','I','K','H'],
                   ['A','E','H','F','G','I','K','','',''],
                   ['A','C','I','F','H','G','','','','']], 
                  columns=['A1', 'A2', 'A3','A4', 'A5', 'A6', 'A7', 'A8', 'A9', 'A10'])

pd.DataFrame(columns=df.columns, data=LabelEncoder().fit_transform(df.values.flatten()).reshape(df.shape))

    A1  A2  A3  A4  A5  A6  A7  A8  A9  A10
0   1   2   3   4   5   6   7   9   10  8
1   1   5   8   6   7   9   10  0   0   0
2   1   3   9   6   8   7   0   0   0   0

我查看了LabelEncoder的源代码(https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/blob/master/sklearn/preprocessing/label.py)。它基于一组numpy变换,其中一个是np.unique()。这个函数只接受一维数组输入。(如果我说错了请指正)。

非常粗略的想法…… 首先,确定哪些列需要LabelEncoder,然后循环遍历每个列。

def cat_var(df): 
    """Identify categorical features. 

    Parameters
    ----------
    df: original df after missing operations 

    Returns
    -------
    cat_var_df: summary df with col index and col name for all categorical vars
    """
    col_type = df.dtypes
    col_names = list(df)

    cat_var_index = [i for i, x in enumerate(col_type) if x=='object']
    cat_var_name = [x for i, x in enumerate(col_names) if i in cat_var_index]

    cat_var_df = pd.DataFrame({'cat_ind': cat_var_index, 
                               'cat_name': cat_var_name})

    return cat_var_df



from sklearn.preprocessing import LabelEncoder 

def column_encoder(df, cat_var_list):
    """Encoding categorical feature in the dataframe

    Parameters
    ----------
    df: input dataframe 
    cat_var_list: categorical feature index and name, from cat_var function

    Return
    ------
    df: new dataframe where categorical features are encoded
    label_list: classes_ attribute for all encoded features 
    """

    label_list = []
    cat_var_df = cat_var(df)
    cat_list = cat_var_df.loc[:, 'cat_name']

    for index, cat_feature in enumerate(cat_list): 

        le = LabelEncoder()

        le.fit(df.loc[:, cat_feature])    
        label_list.append(list(le.classes_))

        df.loc[:, cat_feature] = le.transform(df.loc[:, cat_feature])

    return df, label_list

返回的df将是编码后的df, label_list将显示所有这些值在相应列中的含义。 这是我为工作编写的数据处理脚本的一个片段。如果你觉得还有什么改进的地方,请告诉我。

编辑: 这里只想提一下,上述方法在处理数据帧时不会遗漏最佳数据。不确定它是如何工作的数据帧包含丢失的数据。(在执行上述方法之前,我已经处理了缺失过程)

这是有可能做到这一切直接在熊猫,是非常适合的独特能力的替代方法。

首先,让我们创建一个字典的字典,将列及其值映射到新的替换值。

transform_dict = {}
for col in df.columns:
    cats = pd.Categorical(df[col]).categories
    d = {}
    for i, cat in enumerate(cats):
        d[cat] = i
    transform_dict[col] = d

transform_dict
{'location': {'New_York': 0, 'San_Diego': 1},
 'owner': {'Brick': 0, 'Champ': 1, 'Ron': 2, 'Veronica': 3},
 'pets': {'cat': 0, 'dog': 1, 'monkey': 2}}

由于这将始终是一个一对一的映射,我们可以反转内部字典以获得新值到原始值的映射。

inverse_transform_dict = {}
for col, d in transform_dict.items():
    inverse_transform_dict[col] = {v:k for k, v in d.items()}

inverse_transform_dict
{'location': {0: 'New_York', 1: 'San_Diego'},
 'owner': {0: 'Brick', 1: 'Champ', 2: 'Ron', 3: 'Veronica'},
 'pets': {0: 'cat', 1: 'dog', 2: 'monkey'}}

现在,我们可以使用replace方法的独特功能来获取一个嵌套的字典列表,并使用外部键作为列,使用内部键作为我们想要替换的值。

df.replace(transform_dict)
   location  owner  pets
0         1      1     0
1         0      2     1
2         0      0     0
3         1      1     2
4         1      3     1
5         0      2     1

通过再次链接replace方法,我们可以很容易地回到原来的方法

df.replace(transform_dict).replace(inverse_transform_dict)
    location     owner    pets
0  San_Diego     Champ     cat
1   New_York       Ron     dog
2   New_York     Brick     cat
3  San_Diego     Champ  monkey
4  San_Diego  Veronica     dog
5   New_York       Ron     dog

这是脚本

from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
le = LabelEncoder()
col_list = df.select_dtypes(include = "object").columns
for colsn in col_list:
    df[colsn] = le.fit_transform(df[colsn].astype(str))

假设你只是想获得一个sklearn.预处理. labelencoder()对象,可以用来表示你的列,你所要做的就是:

le.fit(df.columns)

在上面的代码中,每一列都有一个唯一的数字。 更精确地说,你将得到df的1:1映射。列到le.transform(df.columns.get_values())。要获得列的编码,只需将其传递给le.transform(…)。作为一个例子,下面将得到每一列的编码:

le.transform(df.columns.get_values())

假设你想为你所有的行标签创建一个sklearn.预处理. labelencoder()对象,你可以这样做:

le.fit([y for x in df.get_values() for y in x])

在本例中,您很可能拥有非唯一的行标签(如您的问题所示)。要查看编码器创建了哪些类,可以执行le.classes_。你会注意到,这应该具有与set中相同的元素(y for x in df.get_values() for y in x)。再次使用le.transform(…)将行标签转换为编码标签。例如,如果您想检索df. xml文件中第一列的标签。列数组和第一行,你可以这样做:

le.transform([df.get_value(0, df.columns[0])])

你在评论中提出的问题有点复杂,但仍然可以 完成:

le.fit([str(z) for z in set((x[0], y) for x in df.iteritems() for y in x[1])])

上面的代码实现了以下功能:

使所有(列,行)对的唯一组合 将每个对表示为元组的字符串版本。这是克服LabelEncoder类不支持元组作为类名的一种变通方法。 将新项目贴合到LabelEncoder。

现在要使用这个新模型就有点复杂了。假设我们想要提取在前一个例子中查找的同一项的表示(df中的第一列)。列和第一行),我们可以这样做:

le.transform([str((df.columns[0], df.get_value(0, df.columns[0])))])

记住,现在每个查找都是一个元组的字符串表示 包含(列、行)。