我想使用ggplot2包并排放置两个图,即执行par(mfrow=c(1,2))的等效操作。

例如,我想让下面两个图以相同的比例并排显示。

x <- rnorm(100)
eps <- rnorm(100,0,.2)
qplot(x,3*x+eps)
qplot(x,2*x+eps)

我需要把它们放到同一个数据帧里吗?

qplot(displ, hwy, data=mpg, facets = . ~ year) + geom_smooth()

当前回答

Ggplot2基于网格图形,网格图形提供了在页面上安排图形的不同系统。par(mfrow…)命令并没有直接的对等物,因为网格对象(称为grobs)不一定是立即绘制的,但在转换为图形输出之前,可以作为常规R对象存储和操作。这比现在绘制基础图形的模型具有更大的灵活性,但策略必然略有不同。

我编写grid.arrange()是为了提供一个尽可能接近par(mfrow)的简单接口。在其最简单的形式中,代码看起来像:

library(ggplot2)
x <- rnorm(100)
eps <- rnorm(100,0,.2)
p1 <- qplot(x,3*x+eps)
p2 <- qplot(x,2*x+eps)

library(gridExtra)
grid.arrange(p1, p2, ncol = 2)

在这个小插图中详细介绍了更多的选项。

一个常见的抱怨是,图不一定是对齐的,例如,当它们有不同大小的轴标签时,但这是通过设计:网格。Arrange没有尝试处理特殊情况下的ggplot2对象,并将它们与其他grobs(例如,晶格图)同等对待。它只是将抓取放在矩形布局中。

对于ggplot2对象的特殊情况,我编写了另一个函数ggarrange,该函数具有类似的接口,它尝试对齐绘图面板(包括分面图),并尝试尊重用户定义的纵横比。

library(egg)
ggarrange(p1, p2, ncol = 2)

这两个函数都与ggsave()兼容。对于不同选项的一般概述和一些历史背景,本小插图提供了额外的信息。

其他回答

您可以使用温斯顿张的R食谱下面的多绘图函数

multiplot(plot1, plot2, cols=2)

multiplot <- function(..., plotlist=NULL, cols) {
    require(grid)

    # Make a list from the ... arguments and plotlist
    plots <- c(list(...), plotlist)

    numPlots = length(plots)

    # Make the panel
    plotCols = cols                          # Number of columns of plots
    plotRows = ceiling(numPlots/plotCols) # Number of rows needed, calculated from # of cols

    # Set up the page
    grid.newpage()
    pushViewport(viewport(layout = grid.layout(plotRows, plotCols)))
    vplayout <- function(x, y)
        viewport(layout.pos.row = x, layout.pos.col = y)

    # Make each plot, in the correct location
    for (i in 1:numPlots) {
        curRow = ceiling(i/plotCols)
        curCol = (i-1) %% plotCols + 1
        print(plots[[i]], vp = vplayout(curRow, curCol ))
    }

}

如果您希望使用循环绘制多个ggplot图(例如:使用循环在ggplot中创建具有不同y轴值的多个图),上述解决方案可能不太有效,这是分析未知(或大型)数据集的理想步骤(例如,当您希望绘制数据集中所有变量的计数时)。

下面的代码展示了如何使用上面提到的“multiplot()”来实现这一点,其源代码在这里:http://www.cookbook-r.com/Graphs/Multiple_graphs_on_one_page_(ggplot2):

plotAllCounts <- function (dt){   
  plots <- list();
  for(i in 1:ncol(dt)) {
    strX = names(dt)[i]
    print(sprintf("%i: strX = %s", i, strX))
    plots[[i]] <- ggplot(dt) + xlab(strX) +
      geom_point(aes_string(strX),stat="count")
  }

  columnsToPlot <- floor(sqrt(ncol(dt)))
  multiplot(plotlist = plots, cols = columnsToPlot)
}

现在运行函数-以获取在一页上使用ggplot打印的所有变量的Counts

dt = ggplot2::diamonds
plotAllCounts(dt)

需要注意的一点是: 在上面的代码中使用aes(get(strX)),而不是aes_string(strX)将不会绘制所需的图形,这是在处理ggplot时通常在循环中使用的。相反,它会多次绘制最后一个图形。我还没有弄清楚为什么-它可能必须做aes和aes_string在ggplot中被调用。

除此之外,希望你会发现这个函数有用。

使用补丁包,你可以简单地使用+运算符:

library(ggplot2)
library(patchwork)

p1 <- ggplot(mtcars) + geom_point(aes(mpg, disp))
p2 <- ggplot(mtcars) + geom_boxplot(aes(gear, disp, group = gear))


p1 + p2

其他操作符包括/,用于堆叠图,并排放置图,以及(),用于对元素进行分组。例如,你可以用(p1 | p2 | p3) /p来配置上面一行的3个地块和下面一行的一个地块。有关更多示例,请参阅包文档。

还可以考虑ggpubr包中的ggarrange。它有很多好处,包括在情节之间对齐轴和将常见图例合并为一个图例的选项。

更新:这个答案非常古老。gridExtra::grid.arrange()现在是推荐的方法。 我把这个留在这里,也许有用。


Stephen Turner在Getting Genetics Done博客上发布了arrange()函数(参见文章中的应用说明)

vp.layout <- function(x, y) viewport(layout.pos.row=x, layout.pos.col=y)
arrange <- function(..., nrow=NULL, ncol=NULL, as.table=FALSE) {
 dots <- list(...)
 n <- length(dots)
 if(is.null(nrow) & is.null(ncol)) { nrow = floor(n/2) ; ncol = ceiling(n/nrow)}
 if(is.null(nrow)) { nrow = ceiling(n/ncol)}
 if(is.null(ncol)) { ncol = ceiling(n/nrow)}
        ## NOTE see n2mfrow in grDevices for possible alternative
grid.newpage()
pushViewport(viewport(layout=grid.layout(nrow,ncol) ) )
 ii.p <- 1
 for(ii.row in seq(1, nrow)){
 ii.table.row <- ii.row 
 if(as.table) {ii.table.row <- nrow - ii.table.row + 1}
  for(ii.col in seq(1, ncol)){
   ii.table <- ii.p
   if(ii.p > n) break
   print(dots[[ii.table]], vp=vp.layout(ii.table.row, ii.col))
   ii.p <- ii.p + 1
  }
 }
}