我想使用ggplot2包并排放置两个图,即执行par(mfrow=c(1,2))的等效操作。

例如,我想让下面两个图以相同的比例并排显示。

x <- rnorm(100)
eps <- rnorm(100,0,.2)
qplot(x,3*x+eps)
qplot(x,2*x+eps)

我需要把它们放到同一个数据帧里吗?

qplot(displ, hwy, data=mpg, facets = . ~ year) + geom_smooth()

当前回答

Ggplot2基于网格图形,网格图形提供了在页面上安排图形的不同系统。par(mfrow…)命令并没有直接的对等物,因为网格对象(称为grobs)不一定是立即绘制的,但在转换为图形输出之前,可以作为常规R对象存储和操作。这比现在绘制基础图形的模型具有更大的灵活性,但策略必然略有不同。

我编写grid.arrange()是为了提供一个尽可能接近par(mfrow)的简单接口。在其最简单的形式中,代码看起来像:

library(ggplot2)
x <- rnorm(100)
eps <- rnorm(100,0,.2)
p1 <- qplot(x,3*x+eps)
p2 <- qplot(x,2*x+eps)

library(gridExtra)
grid.arrange(p1, p2, ncol = 2)

在这个小插图中详细介绍了更多的选项。

一个常见的抱怨是,图不一定是对齐的,例如,当它们有不同大小的轴标签时,但这是通过设计:网格。Arrange没有尝试处理特殊情况下的ggplot2对象,并将它们与其他grobs(例如,晶格图)同等对待。它只是将抓取放在矩形布局中。

对于ggplot2对象的特殊情况,我编写了另一个函数ggarrange,该函数具有类似的接口,它尝试对齐绘图面板(包括分面图),并尝试尊重用户定义的纵横比。

library(egg)
ggarrange(p1, p2, ncol = 2)

这两个函数都与ggsave()兼容。对于不同选项的一般概述和一些历史背景,本小插图提供了额外的信息。

其他回答

是的,我认为你需要适当地安排你的数据。一种方法是:

X <- data.frame(x=rep(x,2),
                y=c(3*x+eps, 2*x+eps),
                case=rep(c("first","second"), each=100))

qplot(x, y, data=X, facets = . ~ case) + geom_smooth()

我相信在plyr或重塑中有更好的技巧——我仍然没有真正跟上速度 哈德利设计的这些强大的软件包。

使用重塑包可以完成如下操作。

library(ggplot2)
wide <- data.frame(x = rnorm(100), eps = rnorm(100, 0, .2))
wide$first <- with(wide, 3 * x + eps)
wide$second <- with(wide, 2 * x + eps)
long <- melt(wide, id.vars = c("x", "eps"))
ggplot(long, aes(x = x, y = value)) + geom_smooth() + geom_point() + facet_grid(.~ variable)

使用补丁包,你可以简单地使用+运算符:

library(ggplot2)
library(patchwork)

p1 <- ggplot(mtcars) + geom_point(aes(mpg, disp))
p2 <- ggplot(mtcars) + geom_boxplot(aes(gear, disp, group = gear))


p1 + p2

其他操作符包括/,用于堆叠图,并排放置图,以及(),用于对元素进行分组。例如,你可以用(p1 | p2 | p3) /p来配置上面一行的3个地块和下面一行的一个地块。有关更多示例,请参阅包文档。

并排的任意ggplot(或网格上的n个plot)

gridExtra包中的grid.arrange()函数将组合多个图;这就是把两个放在一起的方法。

require(gridExtra)
plot1 <- qplot(1)
plot2 <- qplot(1)
grid.arrange(plot1, plot2, ncol=2)

当两个图不是基于相同的数据时,这很有用,例如,如果您想在不使用重塑()的情况下绘制不同的变量。

这将把输出作为副作用绘制出来。要将副作用打印到文件中,请指定一个设备驱动程序(如pdf、png等)。

pdf("foo.pdf")
grid.arrange(plot1, plot2)
dev.off()

或者,将arrangeGrob()与ggsave()结合使用,

ggsave("foo.pdf", arrangeGrob(plot1, plot2))

这相当于使用par(mfrow = c(1,2))绘制两个不同的图。这不仅节省了整理数据的时间,而且当你想要两个不同的图时,这是必要的。


附录:facet的使用

切面有助于为不同的群体制作相似的图。下面的许多回答都指出了这一点,但我想用与上面的图等效的例子来强调这种方法。

mydata <- data.frame(myGroup = c('a', 'b'), myX = c(1,1))

qplot(data = mydata, 
    x = myX, 
    facets = ~myGroup)

ggplot(data = mydata) + 
    geom_bar(aes(myX)) + 
    facet_wrap(~myGroup)

更新

cowplot中的plot_grid函数值得作为grid.arrange的替代。参见下面@claus-wilke的回答和这个小插图,了解等效的方法;但该功能允许基于此小插图对地块位置和大小进行更精细的控制。

cowplot软件包以适合出版的方式为您提供了一种很好的方法。

x <- rnorm(100)
eps <- rnorm(100,0,.2)
A = qplot(x,3*x+eps, geom = c("point", "smooth"))+theme_gray()
B = qplot(x,2*x+eps, geom = c("point", "smooth"))+theme_gray()
cowplot::plot_grid(A, B, labels = c("A", "B"), align = "v")