如何找出在R中加载了哪个包版本?

我正在研究如何使用我的大学集群。它安装了2个R版本。系统范围R 2.11 (Debian 6.0)和R 2.14.2在非标准位置。

我正在尝试使用MPI和雪。我要运行的代码如下所示

library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()

它在r2.11上没有任何问题。(我用mpirun -H localhost启动脚本，n1,n2,n3,n4 -n 1 R——slave -f code.R)。现在，当我尝试用R 2.14.2来做这件事时，我得到了以下消息:

Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:

所以R似乎加载了为r2.11编译的snow版本包。我已经在r2.14下将snow安装到我的主文件夹中，并在代码中添加了以下代码行:

.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)

错误之前的输出确认我确实在运行R 2.14.2，我的R packages文件夹在搜索路径的第一个。但我还是得到了错误。

我的问题是，如何确定R中加载的是哪个版本的包?我可以看到安装。包所有的包，其中安装，所以也许有一些功能，列出类似的信息加载包?

当前回答

只需使用帮助(package="my_package")并查看显示的版本。

这假设相同的. libpaths中没有其他包版本。

2019-04-03 02:10:57

其他回答

使用R方法packageDescription获取已安装包的描述，对于版本，只需使用$ version as:

packageDescription("AppliedPredictiveModeling")$Version
[1] "1.1-6"

2016-05-14 05:04:44

你可以使用utils::packageVersion来查看安装的包的版本:

> packageVersion("snow")
[1] ‘0.3.9’

请注意,

一个包将不会被“找到”，除非它有一个包含有效版本字段的描述文件。当没有找到包目录和有合适的目录但没有有效的DESCRIPTION文件时，会给出不同的警告。

虽然听起来像是你想知道你正在运行的R的哪个版本，但在这种情况下，@Justin的sessionInfo建议是可行的。

2012-06-19 14:36:34

老问题，但答案中没有我最喜欢的命令，以快速和简短的概述所有加载的包:

(.packages())

要查看所有加载的包安装了哪个版本，只需使用上面的命令对installed.packages()进行子集化。

installed.packages()[(.packages()),3]

通过更改列号(包版本为3)，您可以以易于阅读的矩阵形式获得存储在installed.packages()中的任何其他信息。下面是版本号和依赖项的示例:

installed.packages()[(.packages()),c(3,5)]

2019-10-04 12:12:25

只需使用帮助(package="my_package")并查看显示的版本。

这假设相同的. libpaths中没有其他包版本。

2019-04-03 02:10:57

您可以使用sessionInfo()来实现这一点。

> sessionInfo()
R version 2.15.0 (2012-03-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8    LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] graphics  grDevices utils     datasets  stats     grid      methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.0  reshape2_1.2.1 plyr_1.7.1    

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] colorspace_1.1-1   dichromat_1.2-4    digest_0.5.2       MASS_7.3-18        memoise_0.1        munsell_0.3       
 [7] proto_0.3-9.2      RColorBrewer_1.0-5 scales_0.2.0       stringr_0.6       
>

然而，根据下面的评论和答案，有更好的选择

> packageVersion("snow")

[1] '0.3.9'

Or:

"Rmpi" %in% loadedNamespaces()

2012-06-19 14:31:47

如何找出在R中加载了哪个包版本?

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