有没有一种“规范”的方法?我一直在使用head-n|tail-1来完成这个任务,但我一直在想是否有一个Bash工具专门从文件中提取一行(或一系列行)。

我所说的“规范”是指一个主要功能就是这样做的程序。


当前回答

这不是一个bash解决方案,但我发现顶级选择不能满足我的需求,例如,

sed 'NUMq;d' file

速度足够快,但挂了几个小时,没有告诉任何进展。我建议编译这个cpp程序并使用它来查找所需的行。您可以使用g++main.cpp编译它,其中main.cpp是包含以下内容的文件。我得到了一个,并执行了它/a.输出

#include <iostream>
#include <string>
#include <fstream>

using namespace std;

int main() {
    string filename;
    cout << "Enter filename ";
    cin >> filename;

    int needed_row_number;
    cout << "Enter row number ";
    cin >> needed_row_number;

    int progress_line_count;
    cout << "Enter at which every number of rows to monitor progress ";
    cin >> progress_line_count;

    char ch;
    int row_counter = 1;
    fstream fin(filename, fstream::in);
    while (fin >> noskipws >> ch) {
        int ch_int = (int) ch;
        if (row_counter == needed_row_number) {
            cout << ch;
        }
        if (ch_int == 10) {
            if (row_counter == needed_row_number) {
                return 0;
            }
            row_counter++;
            if (row_counter % progress_line_count == 0) {
                cout << "Progress: line " << row_counter << endl;
            }
        }

    }
    return 0;
}

其他回答

对于一个巨大的文件来说,头部和尾部的管道会很慢。我建议您这样做:

sed 'NUMq;d' file

其中NUM是要打印的行数;例如,sed’10q;d'文件以打印文件的第10行。

说明:

当行号为NUM时,NUMq将立即退出。

d将删除该行而不是打印该行;这在最后一行被禁止,因为q会导致退出时跳过脚本的其余部分。

如果变量中有NUM,则需要使用双引号而不是单引号:

sed "${NUM}q;d" file

我有一个独特的情况,我可以对本页上提出的解决方案进行基准测试,因此我将此答案作为所提出解决方案的合并,并包含每个解决方案的运行时间。

设置

我有一个3.261千兆字节的ASCII文本数据文件,每行有一个键值对。该文件共包含3339550320行,无法在我尝试过的任何编辑器中打开,包括使用Vim。我需要对这个文件进行子集,以便调查我发现的一些值,这些值仅从第~500000000行开始。

因为文件有很多行:

我只需要提取行的一个子集,就可以对数据进行任何有用的操作。通读每一行,得出我所关心的值,需要很长时间。如果解决方案读取了我关心的行,并继续读取文件的其余部分,那么将浪费时间读取近30亿个不相关的行,所需时间将比需要的时间长6倍。

我最好的方案是只从文件中提取一行,而不读取文件中的任何其他行,但我想不出如何在Bash中实现这一点。

为了我的理智,我不会试图阅读我自己的问题所需要的全部500000000行。相反,我将尝试从3339550320中提取第50000000行(这意味着读取整个文件需要比所需时间长60倍)。

我将使用内置的时间对每个命令进行基准测试。

基线

首先,让我们看看头尾解决方案是如何实现的:

$ time head -50000000 myfile.ascii | tail -1
pgm_icnt = 0

real    1m15.321s

5000万行的基线是00:01:15.321,如果我直冲5亿行,大概需要12.5分钟。

cut

我对这一点半信半疑,但值得一试:

$ time cut -f50000000 -d$'\n' myfile.ascii
pgm_icnt = 0

real    5m12.156s

这只跑了00:05:12.156,比基线慢得多!我不确定它是在停止之前读取整个文件还是仅读取5000万行,但无论如何,这似乎不是解决问题的可行方案。

AWK

我只使用出口运行解决方案,因为我不打算等待完整文件运行:

$ time awk 'NR == 50000000 {print; exit}' myfile.ascii
pgm_icnt = 0

real    1m16.583s

这段代码运行时间为00:01:16.583,仅慢了约1秒,但与基线相比仍没有改善。按照这个速度,如果退出命令被排除,那么读取整个文件可能需要大约76分钟!

Perl

我还运行了现有的Perl解决方案:

$ time perl -wnl -e '$.== 50000000 && print && exit;' myfile.ascii
pgm_icnt = 0

real    1m13.146s

该代码在00:01:13.146运行,比基线快了约2秒。如果我用5000万美元来运行它,可能需要大约12分钟。

sed

上面的答案是我的结果:

$ time sed "50000000q;d" myfile.ascii
pgm_icnt = 0

real    1m12.705s

这段代码以00:01:12.705运行,比基线快3秒,比Perl快0.4秒。如果我在整个500000000行上运行它,可能需要大约12分钟。

映射文件

我有bash 3.1,因此无法测试mapfile解决方案。

结论

看起来,在大多数情况下,很难改进头尾解决方案。最好情况下,sed解决方案可提高约3%的效率。

(使用公式%=(运行时/基线-1)*100计算的百分比)

第50000000行

00:01:12.705(-00:00:02.616=-3.47%)秒00:01:13.146(00:00:02.175=-2.89%)perl00:01:15.321(+00:00:00.000=+0.00%)头部|尾部00:01:16.583(+00:00:01.262=+1.68%)awk00:05:12.156(+000:03:56.835=+314.43%)切割

第500000000行

00:12:07.050(-00:00:26.160)秒00:12:11.460(-00:00:21.750)佩尔00:12:33.210(+00:00:00.000)头|尾00:12:45.830(+00:00:12.620)awk00:52:01.560(+00:40:31.650)切割

行3338559320

01:20:54.599(-00:03:05.327)秒01:21:24.045(-00:02:25.227)佩尔01:23:49.273(+00:00:00.000)头|尾01:25:13.548(+000:02:35.735)awk05:47:23.026(+04:24:26.246)切割

UPDATE 1:在awk中找到了更快的方法

仅需5.353秒即可获得133.6 mn以上的行:

行号='133668997';(时间(pvE0<~/master_primelist_18a.txt|LC_ALL=C mawk2-F'^$'-v\_=“${rownum}”--'_{exit}!--_'))

in0: 5.45GiB 0:00:05 [1.02GiB/s] [1.02GiB/s] [======> ] 71%            
     ( pvE 0.1 in0 < ~/master_primelist_18a.txt | 
     LC_ALL=C mawk2 -F'^$' -v  -- ; )  5.01s user 

1.21s系统116%cpu 5.353总计

77.37219=195591955519519519559551=0x296B0FA7D668C4A64F7F=

===============================================

我想质疑perl比awk更快的观点:

因此,虽然我的测试文件的行数没有那么多,但它的大小也是原来的两倍,为7.58GB-

我甚至给了perl一些内置的优势——比如行号中的硬编码,并且还排在第二位,从而从OS缓存机制中获得了任何潜在的加速(如果有的话)

 f="$( grealpath -ePq  ~/master_primelist_18a.txt )"
 rownum='133668997'
 fg;fg; pv < "${f}" | gwc -lcm 
 echo; sleep 2; 
 echo; 
 ( time ( pv -i 0.1 -cN in0 < "${f}" | 
        
    LC_ALL=C mawk2 '_{exit}_=NR==+__' FS='^$' __="${rownum}" 

 ) ) | mawk 'BEGIN { print } END { print _ } NR' 
 sleep 2
 ( time ( pv -i 0.1 -cN in0 < "${f}" | 

    LC_ALL=C perl -wnl -e '$.== 133668997 && print && exit;' 

 ) ) | mawk 'BEGIN { print }  END { print _ } NR' ;

fg: no current job
fg: no current job
7.58GiB 0:00:28 [ 275MiB/s] [============>] 100%
        
148,110,134 8,134,435,629 8,134,435,629   <<<< rows, chars, and bytes 
                                               count as reported by gnu-wc



      in0: 5.45GiB 0:00:07 [ 701MiB/s] [=> ] 71%            
( pv -i 0.1 -cN in0 < "${f}" | LC_ALL=C mawk2 '_{exit}_=NR==+__' FS='^$' ; )  
   6.22s user 2.56s system 110% cpu 7.966 total
   77.37219=195591955519519519559551=0x296B0FA7D668C4A64F7F=


      in0: 5.45GiB 0:00:17 [ 328MiB/s] [=> ] 71%            
( pv -i 0.1 -cN in0 < "${f}" | LC_ALL=C perl -wnl -e ; )  
   14.22s user 3.31s system 103% cpu 17.014 total
   77.37219=195591955519519519559551=0x296B0FA7D668C4A64F7F=

我可以用perl5.36甚至perl-6重新运行测试,如果你认为这会有所不同(也没有安装)

7.966秒(mawk2)与17.014秒(perl 5.34)

在这两者之间,后者是前者的两倍多,显然哪一种在ASCII文件中获取单行数据确实更快。

This is perl 5, version 34, subversion 0 (v5.34.0) built for darwin-thread-multi-2level

Copyright 1987-2021, Larry Wall


mawk 1.9.9.6, 21 Aug 2016, Copyright Michael D. Brennan

这不是一个bash解决方案,但我发现顶级选择不能满足我的需求,例如,

sed 'NUMq;d' file

速度足够快,但挂了几个小时,没有告诉任何进展。我建议编译这个cpp程序并使用它来查找所需的行。您可以使用g++main.cpp编译它,其中main.cpp是包含以下内容的文件。我得到了一个,并执行了它/a.输出

#include <iostream>
#include <string>
#include <fstream>

using namespace std;

int main() {
    string filename;
    cout << "Enter filename ";
    cin >> filename;

    int needed_row_number;
    cout << "Enter row number ";
    cin >> needed_row_number;

    int progress_line_count;
    cout << "Enter at which every number of rows to monitor progress ";
    cin >> progress_line_count;

    char ch;
    int row_counter = 1;
    fstream fin(filename, fstream::in);
    while (fin >> noskipws >> ch) {
        int ch_int = (int) ch;
        if (row_counter == needed_row_number) {
            cout << ch;
        }
        if (ch_int == 10) {
            if (row_counter == needed_row_number) {
                return 0;
            }
            row_counter++;
            if (row_counter % progress_line_count == 0) {
                cout << "Progress: line " << row_counter << endl;
            }
        }

    }
    return 0;
}

要使用sed和变量作为行号打印第n行,请执行以下操作:

a=4
sed -e $a'q:d' file

这里的“-e”标志用于将脚本添加到要执行的命令中。