如果您只是在寻找极其精确的流逝时间度量，请使用System.nanoTime()。System.currentTimeMillis()将为您提供自epoch以来可能最精确的以毫秒为单位的经过时间，但是System.nanoTime()将为您提供相对于某个任意点的纳秒精确时间。

摘自Java文档:

public static long nanoTime() Returns the current value of the most precise available system timer, in nanoseconds. This method can only be used to measure elapsed time and is not related to any other notion of system or wall-clock time. The value returned represents nanoseconds since some fixed but arbitrary origin time (perhaps in the future, so values may be negative). This method provides nanosecond precision, but not necessarily nanosecond accuracy. No guarantees are made about how frequently values change. Differences in successive calls that span greater than approximately 292 years (263 nanoseconds) will not accurately compute elapsed time due to numerical overflow.

例如，要测量一些代码执行所需的时间:

long startTime = System.nanoTime();    
// ... the code being measured ...    
long estimatedTime = System.nanoTime() - startTime;

更多信息请参见:JavaDoc System.nanoTime()和JavaDoc System.currentTimeMillis()。

Arkadiy更新:我在Oracle Java 8中观察到System.currentTimeMillis()在Windows 7上更正确的行为。时间以1毫秒的精度返回。OpenJDK中的源代码并没有改变，所以我不知道是什么原因导致了更好的行为。

Sun的David Holmes在几年前发表了一篇博客文章，其中非常详细地介绍了Java计时api(特别是System.currentTimeMillis()和System.nanoTime())，以及您希望在何时使用它们，以及它们在内部是如何工作的。

热点虚拟机内部:时钟、定时器和调度事件-第一部分- Windows

Java在Windows上为具有定时等待参数的API使用的计时器的一个非常有趣的方面是，计时器的分辨率可以根据可能已经进行的其他API调用而改变-系统范围(不仅仅是在特定进程中)。他展示了一个使用Thread.sleep()会导致分辨率改变的例子。

这里的一个问题是nanoTime方法的不一致性。对于相同的输入，它不会给出非常一致的值。currentTimeMillis在性能和一致性方面做得更好，而且，尽管没有nanoTime那么精确，但它的误差范围更低，因此它的值更准确。因此，我建议您使用currentTimeMillis

是的，如果需要这样的精度，请使用System.nanoTime()，但请注意，您需要Java 5+ JVM。

在我的XP系统上，我看到系统时间报告为至少100微秒278纳秒，使用以下代码:

private void test() {
    System.out.println("currentTimeMillis: "+System.currentTimeMillis());
    System.out.println("nanoTime         : "+System.nanoTime());
    System.out.println();

    testNano(false);                                                            // to sync with currentTimeMillis() timer tick
    for(int xa=0; xa<10; xa++) {
        testNano(true);
        }
    }

private void testNano(boolean shw) {
    long strMS=System.currentTimeMillis();
    long strNS=System.nanoTime();
    long curMS;
    while((curMS=System.currentTimeMillis()) == strMS) {
        if(shw) { System.out.println("Nano: "+(System.nanoTime()-strNS)); }
        }
    if(shw) { System.out.println("Nano: "+(System.nanoTime()-strNS)+", Milli: "+(curMS-strMS)); }
    }

正如其他人所说，currentTimeMillis是时钟时间，由于夏令时而改变(不是:夏令时和时区与currentTimeMillis无关，其余为真)，用户更改时间设置，闰秒和互联网时间同步。如果您的应用程序依赖于单调增加运行时间值，您可能更喜欢nanoTime。

你可能认为玩家不会在游戏过程中摆弄时间设置，也许你是对的。但不要低估互联网时间同步或远程桌面用户带来的破坏。nanoTime API不会受到这种中断的影响。

如果你想使用时钟时间，但避免由于互联网时间同步造成的间断，你可以考虑一个NTP客户端，如Meinberg，它“调整”时钟速率为零，而不是定期重置时钟。

这是我的亲身经历。在我开发的一个天气应用程序中，我得到了随机出现的风速峰值。我花了一段时间才意识到，我的时间库被一台典型PC上的时钟时间行为打乱了。当我开始使用nanoTime时，我所有的问题都消失了。对于我的应用程序来说，一致性(单调性)比原始精度或绝对精度更重要。

旧的jvm中不支持System.nanoTime()。如果这是一个问题，请坚持使用currentTimeMillis

关于准确性，你几乎是正确的。在一些Windows机器上，currentTimeMillis()的分辨率约为10ms(而不是50ms)。我不知道为什么，但是一些Windows机器和Linux机器一样准确。

我过去使用过GAGETimer，取得了一定的成功。