我在Windows上运行R，不是作为管理员。当我安装一个包时，下面的命令不起作用:
> install.packages("zoo")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
'lib = "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"' is not writable
要安装一个包，我必须指定一个库位置:
install.packages("zoo", lib="C:/software/Rpackages")
要加载一个包，我还必须指定库的位置:
library("zoo", lib.loc="C:/software/Rpackages")
所有这些都没问题，但我想看看是否可以将C:/software/Rpackages添加到库路径中，这样就不必每次都输入它了。
当我在网上搜索时，我发现这样做的一种方法是编辑Rprofile。站点文件并添加行
.libPaths("C:/software/Rpackages")
然而，在这样做并启动RStudio之后，这是我得到的输出
> .libPaths()
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library" "C:/Program Files/RStudio/R/library"
我添加到Rprofile的. libpaths命令。网站似乎没有任何效果!为什么会这样呢?或者更重要的是，如何解决这个问题，以便在不输入库位置的情况下安装和加载包?
注意:如果我启动RStudio， .libPaths()命令似乎可以正常工作
.libPaths("C:/software/Rpackages")
> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages" "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"
这不是很奇怪吗?
我在这里找到了我认为的解决方案(感谢SFU的Carl Schwarz)，您添加了一个个人库，无论使用R还是Rstudio，它都是永久识别的(您不必每次会话都定义它)，Rstudio将它作为我Mac机器上的默认值。我没有在SO上看到它明确地列出这一点，所以我总结了他们提供的步骤，先是Windows，然后是Mac。
Windows 7操作系统:
Create a directory on the drive where you want to have your personal library, e.g. C:\User\Rlibs (or another that you have permissions to)
Search for/go to "Edit environment variable for your account" in the Windows search bar to edit control panel settings
Click "New..." in the middle of the "Environmental Variables" window
In the "New User Variable" window, type R_LIBS for the "Variable name", and the path to the personal library directory you created, e.g. C:\User\Rlibs
Click OK and you should see the Variable/Value pair in the User variables window
Click OK again
现在，当您启动R(或Rstudio)并键入. libpaths()命令时，您应该会看到您创建的个人库以及R系统库。
Mac:
在“Home”或“username”目录中创建一个名为Rlibs的文件夹
启动终端应用程序
类型:echo "R_LIBS=~/Rlibs" > . renviron确保拼写和大小写匹配。
输入ls -a查看目录中文件的完整列表，现在应该包括.Renvrion
验证.Renviron文件已正确设置:更多.Renviron
启动R/Rstudio并输入. libpaths()，您应该会看到个人库的新路径。
我通常尝试将所有的包保存在一个库中，但是如果您想添加一个库，为什么不将新的库(必须已经存在于您的文件系统中)附加到现有的库路径中呢?
.libPaths( c( .libPaths(), "~/userLibrary") )
# obviously this would need to be a valid file directory in your OS
# min just happened to be on a Mac that day
或者(这将使userLibrary成为第一个放置新包的地方):
.libPaths( c( "~/userLibrary" , .libPaths() ) )
然后我得到(至少回到我最初写这篇文章的时候):
> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library"
[2] "/Users/user_name/userLibrary"
libpaths函数与大多数其他非图形函数略有不同。它通过副作用起作用。Sys. Sys。getenv和Sys。setenv报告和改变R环境变量已经被分开，但是. libpaths可以报告或改变它的目标。
关于R启动过程的信息可以在启动帮助页面上阅读，在https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200549016-Customizing-RStudio上有RStudio材料
在您的案例中，RStudio似乎不尊重Rprofile。站点设置，或者通过从RStudio默认值之一读取. rprofile设置来覆盖它们。还应该提到的是，该操作的结果还将调用的内容追加到. library和. library。站点，这就是为什么RStudio-(或任何其他IDE或网络安装-)托管的R可能会表现出不同的行为的进一步原因。
因为Sys.getenv()返回R进程的当前系统环境，你可以看到库和其他路径:
Sys.getenv()[ grep("LIB|PATH", names(Sys.getenv())) ]
存储和访问包的两个关键是(现在在Linux机器上是不同的):
R_LIBS_SITE /usr/local/lib/R/site-library:/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library
R_LIBS_USER /home/david/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5.1/
正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值，而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。
要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER，请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径)，例如:
Variable name: R_LIBS_USER
Variable value: C:/software/Rpackages
如果由于某种原因您无法访问控制面板，您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行，并从那里添加环境变量。
设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中，无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。
如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio，那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下，将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时，Rprofile解决方案不起作用，因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。
