我在Windows上运行R,不是作为管理员。当我安装一个包时,下面的命令不起作用:

> install.packages("zoo")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  'lib = "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"' is not writable

要安装一个包,我必须指定一个库位置:

install.packages("zoo", lib="C:/software/Rpackages")

要加载一个包,我还必须指定库的位置:

library("zoo", lib.loc="C:/software/Rpackages")

所有这些都没问题,但我想看看是否可以将C:/software/Rpackages添加到库路径中,这样就不必每次都输入它了。

当我在网上搜索时,我发现这样做的一种方法是编辑Rprofile。站点文件并添加行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

然而,在这样做并启动RStudio之后,这是我得到的输出

> .libPaths()
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library" "C:/Program Files/RStudio/R/library" 

我添加到Rprofile的. libpaths命令。网站似乎没有任何效果!为什么会这样呢?或者更重要的是,如何解决这个问题,以便在不输入库位置的情况下安装和加载包?

注意:如果我启动RStudio, .libPaths()命令似乎可以正常工作

.libPaths("C:/software/Rpackages")
> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"

这不是很奇怪吗?


当前回答

我也遇到过同样的问题,我遇到了这个。如果你想创建另一个位置c(" c:/Users/mynewlocation")也应该可以工作。正如这里提到的“您应该能够右键单击Rstudio.exe图标,单击属性,并选择一个选项,始终以管理员身份运行Rstudio。当你想打开Rstudio时,一定要使用相同的图标。”

    myPaths <- .libPaths()   # get the paths
myPaths <- c(myPaths[2], myPaths[1])  # switch them
.libPaths(myPaths)  # reassign them

其他回答

只需将R库的默认文件夹更改为没有管理员权限的目录,例如:

.libPaths("C:/R/libs")

在Ubuntu上,为用户更改默认库路径的推荐方法是在~/. conf中设置R_LIBS_USER变量。Renviron文件。

touch ~/.Renviron
echo "R_LIBS_USER=/custom/path/in/absolute/form" >> ~/.Renviron

正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值,而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。

要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER,请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径),例如:

Variable name: R_LIBS_USER 
Variable value: C:/software/Rpackages  

如果由于某种原因您无法访问控制面板,您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行,并从那里添加环境变量。

设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中,无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。

如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio,那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下,将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时,Rprofile解决方案不起作用,因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。

我真的很难理解。当我上次重新安装OS & Rstudio时,gorkypl给出了正确的解决方案,但这一次,设置我的环境变量没有解决。

卸载R和Rstudio,创建目录C:\R和C:\Rstudio,然后重新安装它们。

将R_LIBS_USER用户变量定义到您的首选目录(根据gorkypl的回答),并重新启动您的机器以加载user变量。打开Rstudio,错误应该消失了。

您还可以使用Sys.setenv()将R_LIBS_USER修改为您的替代库的路径,这更容易,而且不需要重新启动您的计算机。

要查看R_LIBS_USER设置为什么: ? Sys.getenv ()

阅读帮助(启动)是有用的。

我在这里找到了我认为的解决方案(感谢SFU的Carl Schwarz),您添加了一个个人库,无论使用R还是Rstudio,它都是永久识别的(您不必每次会话都定义它),Rstudio将它作为我Mac机器上的默认值。我没有在SO上看到它明确地列出这一点,所以我总结了他们提供的步骤,先是Windows,然后是Mac。

Windows 7操作系统:

Create a directory on the drive where you want to have your personal library, e.g. C:\User\Rlibs (or another that you have permissions to) Search for/go to "Edit environment variable for your account" in the Windows search bar to edit control panel settings Click "New..." in the middle of the "Environmental Variables" window In the "New User Variable" window, type R_LIBS for the "Variable name", and the path to the personal library directory you created, e.g. C:\User\Rlibs Click OK and you should see the Variable/Value pair in the User variables window Click OK again

现在,当您启动R(或Rstudio)并键入. libpaths()命令时,您应该会看到您创建的个人库以及R系统库。

Mac:

在“Home”或“username”目录中创建一个名为Rlibs的文件夹 启动终端应用程序 类型:echo "R_LIBS=~/Rlibs" > . renviron确保拼写和大小写匹配。 输入ls -a查看目录中文件的完整列表,现在应该包括.Renvrion 验证.Renviron文件已正确设置:更多.Renviron

启动R/Rstudio并输入. libpaths(),您应该会看到个人库的新路径。