https://superuser.com/questions/749283/change-rstudio-library-path-at-home-directory

编辑~/。伦维隆

R_LIBS_USER=/some/path

我正在调查这个问题，因为R安装到默认位置有问题，而只是将包放入临时文件夹。原来这是Mcaffee Endpoint Security的最新更新，显然r有问题。你可以在安装包时禁用威胁保护，它会正常工作。

我通常尝试将所有的包保存在一个库中，但是如果您想添加一个库，为什么不将新的库(必须已经存在于您的文件系统中)附加到现有的库路径中呢?

.libPaths( c( .libPaths(), "~/userLibrary") )
 # obviously this would need to be a valid file directory in your OS
 # min just happened to be on a Mac that day

或者(这将使userLibrary成为第一个放置新包的地方):

.libPaths( c( "~/userLibrary" , .libPaths() ) )

然后我得到(至少回到我最初写这篇文章的时候):

> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library"
[2] "/Users/user_name/userLibrary"  

libpaths函数与大多数其他非图形函数略有不同。它通过副作用起作用。Sys. Sys。getenv和Sys。setenv报告和改变R环境变量已经被分开，但是. libpaths可以报告或改变它的目标。

关于R启动过程的信息可以在启动帮助页面上阅读，在https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200549016-Customizing-RStudio上有RStudio材料

在您的案例中，RStudio似乎不尊重Rprofile。站点设置，或者通过从RStudio默认值之一读取. rprofile设置来覆盖它们。还应该提到的是，该操作的结果还将调用的内容追加到. library和. library。站点，这就是为什么RStudio-(或任何其他IDE或网络安装-)托管的R可能会表现出不同的行为的进一步原因。

因为Sys.getenv()返回R进程的当前系统环境，你可以看到库和其他路径:

Sys.getenv()[ grep("LIB|PATH", names(Sys.getenv())) ]

存储和访问包的两个关键是(现在在Linux机器上是不同的):

R_LIBS_SITE                          /usr/local/lib/R/site-library:/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library
R_LIBS_USER                          /home/david/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5.1/
 

通过将代码放在默认工作目录下的. rprofile文件中，我设法解决了这个问题。

首先，我找到了默认工作目录的位置

> getwd()
[1] "C:/Users/me/Documents"

然后，我使用文本编辑器编写了一个简单的.Rprofile文件，其中包含以下一行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

最后，当我启动R并运行.libPaths()时，我得到了所需的输出:

> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"
[3] "C:/Program Files/RStudio/R/library"

我也遇到过同样的问题，我遇到了这个。如果你想创建另一个位置c(" c:/Users/mynewlocation")也应该可以工作。正如这里提到的“您应该能够右键单击Rstudio.exe图标，单击属性，并选择一个选项，始终以管理员身份运行Rstudio。当你想打开Rstudio时，一定要使用相同的图标。”

    myPaths <- .libPaths()   # get the paths
myPaths <- c(myPaths[2], myPaths[1])  # switch them
.libPaths(myPaths)  # reassign them

我真的很难理解。当我上次重新安装OS & Rstudio时，gorkypl给出了正确的解决方案，但这一次，设置我的环境变量没有解决。

卸载R和Rstudio，创建目录C:\R和C:\Rstudio，然后重新安装它们。

将R_LIBS_USER用户变量定义到您的首选目录(根据gorkypl的回答)，并重新启动您的机器以加载user变量。打开Rstudio，错误应该消失了。

您还可以使用Sys.setenv()将R_LIBS_USER修改为您的替代库的路径，这更容易，而且不需要重新启动您的计算机。

要查看R_LIBS_USER设置为什么: ? Sys.getenv ()

阅读帮助(启动)是有用的。