我在Windows上运行R,不是作为管理员。当我安装一个包时,下面的命令不起作用:

> install.packages("zoo")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  'lib = "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"' is not writable

要安装一个包,我必须指定一个库位置:

install.packages("zoo", lib="C:/software/Rpackages")

要加载一个包,我还必须指定库的位置:

library("zoo", lib.loc="C:/software/Rpackages")

所有这些都没问题,但我想看看是否可以将C:/software/Rpackages添加到库路径中,这样就不必每次都输入它了。

当我在网上搜索时,我发现这样做的一种方法是编辑Rprofile。站点文件并添加行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

然而,在这样做并启动RStudio之后,这是我得到的输出

> .libPaths()
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library" "C:/Program Files/RStudio/R/library" 

我添加到Rprofile的. libpaths命令。网站似乎没有任何效果!为什么会这样呢?或者更重要的是,如何解决这个问题,以便在不输入库位置的情况下安装和加载包?

注意:如果我启动RStudio, .libPaths()命令似乎可以正常工作

.libPaths("C:/software/Rpackages")
> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"

这不是很奇怪吗?


当前回答

https://superuser.com/questions/749283/change-rstudio-library-path-at-home-directory

编辑~/。伦维隆

R_LIBS_USER=/some/path

其他回答

由于这里的大多数答案都与Windows和Mac OS有关,(考虑到我也在努力解决这个问题)我决定在Arch Linux安装中发布帮助我解决这个问题的过程。

步骤1:

Do a global search of your system (e.g. ANGRYSearch) for the term Renviron (which is the configuration file where the settings for the user libraries are set). It should return only two results at the following directory paths: /etc/R/ /usr/lib/R/etc/ NOTE: The Renviron config files stored at 1 & 2 (above) are hot-linked to each other (which means changes made to one file will automatically be applied [ in the same form / structure ] to the other file when the file being edited is saved - [ you also need sudo rights for saving the file post-edit ] ).

步骤2:

导航到第一个目录路径(/etc/R/),并用您最喜欢的文本编辑器打开Renviron文件。 进入Renviron文件后,搜索R_LIBS_USER标记,并将花括号部分中的文本更新为所需的目录路径。 例子: ... 更改来源(原始条目): R_LIBS_USER = $ {R_LIBS_USER - R ~ / / x86_64-pc-linux-gnu-library / 4.0 '} ... 更改到(您想要的条目): R_LIBS_USER = $ {R_LIBS_USER——“~ /应用程序/ R / rUserLibs '}

步骤3:

保存你刚刚编辑的Renviron文件……完成了! !

我正在调查这个问题,因为R安装到默认位置有问题,而只是将包放入临时文件夹。原来这是Mcaffee Endpoint Security的最新更新,显然r有问题。你可以在安装包时禁用威胁保护,它会正常工作。

在Ubuntu上,为用户更改默认库路径的推荐方法是在~/. conf中设置R_LIBS_USER变量。Renviron文件。

touch ~/.Renviron
echo "R_LIBS_USER=/custom/path/in/absolute/form" >> ~/.Renviron

正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值,而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。

要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER,请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径),例如:

Variable name: R_LIBS_USER 
Variable value: C:/software/Rpackages  

如果由于某种原因您无法访问控制面板,您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行,并从那里添加环境变量。

设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中,无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。

如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio,那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下,将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时,Rprofile解决方案不起作用,因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。

通过将代码放在默认工作目录下的. rprofile文件中,我设法解决了这个问题。

首先,我找到了默认工作目录的位置

> getwd()
[1] "C:/Users/me/Documents"

然后,我使用文本编辑器编写了一个简单的.Rprofile文件,其中包含以下一行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

最后,当我启动R并运行.libPaths()时,我得到了所需的输出:

> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"
[3] "C:/Program Files/RStudio/R/library"