在Rprofile中使用. libpaths更改R默认库路径。站点无法正常工作

我在Windows上运行R，不是作为管理员。当我安装一个包时，下面的命令不起作用:

> install.packages("zoo")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  'lib = "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"' is not writable

要安装一个包，我必须指定一个库位置:

install.packages("zoo", lib="C:/software/Rpackages")

要加载一个包，我还必须指定库的位置:

library("zoo", lib.loc="C:/software/Rpackages")

所有这些都没问题，但我想看看是否可以将C:/software/Rpackages添加到库路径中，这样就不必每次都输入它了。

当我在网上搜索时，我发现这样做的一种方法是编辑Rprofile。站点文件并添加行

.libPaths("C:/software/Rpackages")

然而，在这样做并启动RStudio之后，这是我得到的输出

> .libPaths()
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library" "C:/Program Files/RStudio/R/library"

我添加到Rprofile的. libpaths命令。网站似乎没有任何效果!为什么会这样呢?或者更重要的是，如何解决这个问题，以便在不输入库位置的情况下安装和加载包?

注意:如果我启动RStudio， .libPaths()命令似乎可以正常工作

.libPaths("C:/software/Rpackages")
> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages"               "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"

这不是很奇怪吗?

当前回答

我真的很难理解。当我上次重新安装OS & Rstudio时，gorkypl给出了正确的解决方案，但这一次，设置我的环境变量没有解决。

卸载R和Rstudio，创建目录C:\R和C:\Rstudio，然后重新安装它们。

将R_LIBS_USER用户变量定义到您的首选目录(根据gorkypl的回答)，并重新启动您的机器以加载user变量。打开Rstudio，错误应该消失了。

您还可以使用Sys.setenv()将R_LIBS_USER修改为您的替代库的路径，这更容易，而且不需要重新启动您的计算机。

要查看R_LIBS_USER设置为什么: ? Sys.getenv ()

阅读帮助(启动)是有用的。

2015-01-07 16:40:28

其他回答

我真的很难理解。当我上次重新安装OS & Rstudio时，gorkypl给出了正确的解决方案，但这一次，设置我的环境变量没有解决。

卸载R和Rstudio，创建目录C:\R和C:\Rstudio，然后重新安装它们。

将R_LIBS_USER用户变量定义到您的首选目录(根据gorkypl的回答)，并重新启动您的机器以加载user变量。打开Rstudio，错误应该消失了。

您还可以使用Sys.setenv()将R_LIBS_USER修改为您的替代库的路径，这更容易，而且不需要重新启动您的计算机。

要查看R_LIBS_USER设置为什么: ? Sys.getenv ()

阅读帮助(启动)是有用的。

2015-01-07 16:40:28

https://superuser.com/questions/749283/change-rstudio-library-path-at-home-directory

编辑~/。伦维隆

R_LIBS_USER=/some/path

2017-12-14 05:45:00

正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值，而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。

要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER，请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径)，例如:

Variable name: R_LIBS_USER 
Variable value: C:/software/Rpackages

如果由于某种原因您无法访问控制面板，您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行，并从那里添加环境变量。

设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中，无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。

如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio，那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下，将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时，Rprofile解决方案不起作用，因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。

2013-10-29 15:43:23

我正在调查这个问题，因为R安装到默认位置有问题，而只是将包放入临时文件夹。原来这是Mcaffee Endpoint Security的最新更新，显然r有问题。你可以在安装包时禁用威胁保护，它会正常工作。

2017-09-18 23:15:47

getwd()
# [1] "C:/Users/..../software/My R studio"

复制上面的链接，带两个倒置逗号

.libPaths(new="C:/Users/..../software/My R studio")

安装包的默认路径将更改

2016-02-07 13:48:06

在Rprofile中使用. libpaths更改R默认库路径。站点无法正常工作

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