我在Windows上运行R，不是作为管理员。当我安装一个包时，下面的命令不起作用:
> install.packages("zoo")
Installing package(s) into ‘C:/Program Files/R/R-2.15.2/library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
'lib = "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"' is not writable
要安装一个包，我必须指定一个库位置:
install.packages("zoo", lib="C:/software/Rpackages")
要加载一个包，我还必须指定库的位置:
library("zoo", lib.loc="C:/software/Rpackages")
所有这些都没问题，但我想看看是否可以将C:/software/Rpackages添加到库路径中，这样就不必每次都输入它了。
当我在网上搜索时，我发现这样做的一种方法是编辑Rprofile。站点文件并添加行
.libPaths("C:/software/Rpackages")
然而，在这样做并启动RStudio之后，这是我得到的输出
> .libPaths()
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library" "C:/Program Files/RStudio/R/library"
我添加到Rprofile的. libpaths命令。网站似乎没有任何效果!为什么会这样呢?或者更重要的是，如何解决这个问题，以便在不输入库位置的情况下安装和加载包?
注意:如果我启动RStudio， .libPaths()命令似乎可以正常工作
.libPaths("C:/software/Rpackages")
> .libPaths()
[1] "C:/software/Rpackages" "C:/Program Files/R/R-2.15.2/library"
这不是很奇怪吗?
正确的解决方案是将环境变量R_LIBS_USER设置为所需库文件夹的文件路径值，而不是让RStudio识别Rprofile。网站文件。
要在Windows中设置环境变量R_LIBS_USER，请进入控制面板(系统属性->高级系统属性->环境变量->用户变量)到所需的值(库文件夹的路径)，例如:
Variable name: R_LIBS_USER
Variable value: C:/software/Rpackages
如果由于某种原因您无法访问控制面板，您可以尝试运行rundll32 sysdm。cpl,EditEnvironmentVariables在Windows上的命令行，并从那里添加环境变量。
设置R_LIBS_USER将确保库首先显示在. libpaths()中，无论直接启动RStudio还是通过右键单击文件并“打开与”来启动RStudio。
如果总是通过单击RStudio快捷方式启动RStudio，那么Rprofile解决方案就可以工作。在这种情况下，将默认工作目录设置为存放Rprofile的目录就足够了。当单击一个文件启动RStudio时，Rprofile解决方案不起作用，因为这会将工作目录从默认的工作目录更改。
我通常尝试将所有的包保存在一个库中，但是如果您想添加一个库，为什么不将新的库(必须已经存在于您的文件系统中)附加到现有的库路径中呢?
.libPaths( c( .libPaths(), "~/userLibrary") )
# obviously this would need to be a valid file directory in your OS
# min just happened to be on a Mac that day
或者(这将使userLibrary成为第一个放置新包的地方):
.libPaths( c( "~/userLibrary" , .libPaths() ) )
然后我得到(至少回到我最初写这篇文章的时候):
> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library"
[2] "/Users/user_name/userLibrary"
libpaths函数与大多数其他非图形函数略有不同。它通过副作用起作用。Sys. Sys。getenv和Sys。setenv报告和改变R环境变量已经被分开，但是. libpaths可以报告或改变它的目标。
关于R启动过程的信息可以在启动帮助页面上阅读，在https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200549016-Customizing-RStudio上有RStudio材料
在您的案例中，RStudio似乎不尊重Rprofile。站点设置，或者通过从RStudio默认值之一读取. rprofile设置来覆盖它们。还应该提到的是，该操作的结果还将调用的内容追加到. library和. library。站点，这就是为什么RStudio-(或任何其他IDE或网络安装-)托管的R可能会表现出不同的行为的进一步原因。
因为Sys.getenv()返回R进程的当前系统环境，你可以看到库和其他路径:
Sys.getenv()[ grep("LIB|PATH", names(Sys.getenv())) ]
存储和访问包的两个关键是(现在在Linux机器上是不同的):
R_LIBS_SITE /usr/local/lib/R/site-library:/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library
R_LIBS_USER /home/david/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5.1/
