如何使用Bash遍历文本文件的每一行?
使用此脚本:
echo "Start!"
for p in (peptides.txt)
do
echo "${p}"
done
我在屏幕上看到这个输出:
Start!
./runPep.sh: line 3: syntax error near unexpected token `('
./runPep.sh: line 3: `for p in (peptides.txt)'
(后来我想用$p做一些比输出到屏幕更复杂的事情。)
环境变量SHELL是(来自env):
SHELL=/bin/bash
/bin/bash—版本输出:
GNU bash, version 3.1.17(1)-release (x86_64-suse-linux-gnu)
Copyright (C) 2005 Free Software Foundation, Inc.
cat/proc/version输出:
Linux version 2.6.18.2-34-default (geeko@buildhost) (gcc version 4.1.2 20061115 (prerelease) (SUSE Linux)) #1 SMP Mon Nov 27 11:46:27 UTC 2006
peptides.txt文件包含:
RKEKNVQ
IPKKLLQK
QYFHQLEKMNVK
IPKKLLQK
GDLSTALEVAIDCYEK
QYFHQLEKMNVKIPENIYR
RKEKNVQ
VLAKHGKLQDAIN
ILGFMK
LEDVALQILL
这是我的真实例子,如何循环另一个程序输出的行,检查子字符串,从变量中删除双引号,在循环之外使用该变量。我想很多人迟早会问这些问题。
##Parse FPS from first video stream, drop quotes from fps variable
## streams.stream.0.codec_type="video"
## streams.stream.0.r_frame_rate="24000/1001"
## streams.stream.0.avg_frame_rate="24000/1001"
FPS=unknown
while read -r line; do
if [[ $FPS == "unknown" ]] && [[ $line == *".codec_type=\"video\""* ]]; then
echo ParseFPS $line
FPS=parse
fi
if [[ $FPS == "parse" ]] && [[ $line == *".r_frame_rate="* ]]; then
echo ParseFPS $line
FPS=${line##*=}
FPS="${FPS%\"}"
FPS="${FPS#\"}"
fi
done <<< "$(ffprobe -v quiet -print_format flat -show_format -show_streams -i "$input")"
if [ "$FPS" == "unknown" ] || [ "$FPS" == "parse" ]; then
echo ParseFPS Unknown frame rate
fi
echo Found $FPS
在循环外声明变量,设置值并在循环外使用它需要done<<“$(…)”语法。应用程序需要在当前控制台的上下文中运行。命令周围的引号保留输出流的换行符。
子字符串的循环匹配然后读取name=value对,拆分last=字符的右侧部分,删除第一个引号,删除最后一个引号,我们有一个干净的值可以在其他地方使用。