在Bash中循环浏览文件内容

如何使用Bash遍历文本文件的每一行？

使用此脚本：

echo "Start!"
for p in (peptides.txt)
do
    echo "${p}"
done

我在屏幕上看到这个输出：

Start!
./runPep.sh: line 3: syntax error near unexpected token `('
./runPep.sh: line 3: `for p in (peptides.txt)'

（后来我想用$p做一些比输出到屏幕更复杂的事情。）

环境变量SHELL是（来自env）：

SHELL=/bin/bash

/bin/bash—版本输出：

GNU bash, version 3.1.17(1)-release (x86_64-suse-linux-gnu)
Copyright (C) 2005 Free Software Foundation, Inc.

cat/proc/version输出：

Linux version 2.6.18.2-34-default (geeko@buildhost) (gcc version 4.1.2 20061115 (prerelease) (SUSE Linux)) #1 SMP Mon Nov 27 11:46:27 UTC 2006

peptides.txt文件包含：

RKEKNVQ
IPKKLLQK
QYFHQLEKMNVK
IPKKLLQK
GDLSTALEVAIDCYEK
QYFHQLEKMNVKIPENIYR
RKEKNVQ
VLAKHGKLQDAIN
ILGFMK
LEDVALQILL

当前回答

使用while循环，如下所示：

while IFS= read -r line; do
   echo "$line"
done <file

笔记：

如果不正确设置IFS，将丢失缩进。您几乎应该始终在read中使用-r选项。不读取带有for的行

2015-06-09 15:09:00

其他回答

使用while循环，如下所示：

while IFS= read -r line; do
   echo "$line"
done <file

笔记：

如果不正确设置IFS，将丢失缩进。您几乎应该始终在read中使用-r选项。不读取带有for的行

2015-06-09 15:09:00

选项1a：While循环：一次单行：输入重定向

#!/bin/bash
filename='peptides.txt'
echo Start
while read p; do 
    echo "$p"
done < "$filename"

选项1b：While循环：一次单行：打开文件，从文件描述符中读取（在本例中为文件描述符#4）。

#!/bin/bash
filename='peptides.txt'
exec 4<"$filename"
echo Start
while read -u4 p ; do
    echo "$p"
done

2009-10-05 18:18:47

这可能是最简单的答案，也许它在所有情况下都不起作用，但它对我来说很有用：

while read line;do echo "$line";done<peptides.txt

如果需要用括号括起空格：

while read line;do echo \"$line\";done<peptides.txt

啊，这和投票最多的答案差不多，但都在一行。

2021-01-11 04:31:20

对于`cat peptides.txt中的p`做echo“${p}”完成

2022-11-16 02:41:27

这来得很晚，但考虑到这可能会对某人有所帮助，我补充了答案。同样，这可能不是最好的方法。head命令可以与-n参数一起使用，从文件开头读取n行，同样，tail命令可以用于从底部读取。现在，要从文件中提取第n行，我们需要头n行，通过管道将数据传输到管道数据中仅1行的尾部。

   TOTAL_LINES=`wc -l $USER_FILE | cut -d " " -f1 `
   echo $TOTAL_LINES       # To validate total lines in the file

   for (( i=1 ; i <= $TOTAL_LINES; i++ ))
   do
      LINE=`head -n$i $USER_FILE | tail -n1`
      echo $LINE
   done

2019-08-08 09:13:40

在Bash中循环浏览文件内容

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