在R中是否有衡量函数执行时间的标准化方法?
显然我可以用系统。时间，然后取它们的差异，但我想知道是否有一些标准化的方法或功能(不想发明轮子)。
我似乎记得我曾经用过如下的东西:
somesysfunction("myfunction(with,arguments)")
> Start time : 2001-01-01 00:00:00 # output of somesysfunction
> "Result" "of" "myfunction" # output of myfunction
> End time : 2001-01-01 00:00:10 # output of somesysfunction
> Total Execution time : 10 seconds # output of somesysfunction
当前回答
您可以使用Sys.time()。但是，当您在表格或csv文件中记录时差时，不能简单地使用end - start。相反，你应该定义这个单位:
f_name <- function (args*){
start <- Sys.time()
""" You codes here """
end <- Sys.time()
total_time <- as.numeric (end - start, units = "mins") # or secs ...
}
然后你可以使用total_time，它有一个合适的格式。
其他回答
内置函数system.time()将执行此操作。
使用like: system。Time (result <- myfunction(with, arguments))
度量执行时间的一个稍微好一点的方法是使用rbenchmark包。这个包(很容易)允许您指定复制测试的次数，以及相对基准测试应该是多少次。
另见stats.stackexchange上的相关问题
有几个答案提到取两个Sys.time()的差值。
start <- Sys.time()
## ... code here ... ##
end <- Sys.time()
end - start
这将以人类可读的格式打印结果，例如“2秒的时间差”。但是，由于单位可以变化(从“秒”到“分钟”到“天”)，因此，如果多个运行时的单位不同，那么使用此方法在相同基础上比较它们就不太有用。
对于非交互目的，最好指定时间单位。
具体来说，Sys.time()返回一个POSIXct对象。取两个posixct的差值，给出一个difftime类的对象，该对象具有“units”属性。特别是' - '操作被定义为在与POSIXct一起使用时使用difftime()。也就是说,
time2 - time1
等于
difftime(time2, time1)
要指定units属性，添加一个units=参数，例如。
difftime(time2, time1, units="secs")
总而言之，可以使用Sys.time()用指定的单位(秒、分等)来测量运行时。
start <- Sys.time()
## ... code here ... ##
end <- Sys.time()
difftime(end, start, units="secs")
还有proc.time()
你可以用和Sys一样的方法使用。Time但是它给你的结果和system。Time类似。
ptm <- proc.time()
#your function here
proc.time() - ptm
主要区别使用
system.time({ #your function here })
proc.time()方法仍然执行你的函数，而不是仅仅测量时间… 顺便说一下，我喜欢使用系统。时间{}在里面，所以你可以把一组东西…
虽然其他解决方案对于单个函数也很有用，但我推荐使用下面的代码段，因为它更通用、更有效:
Rprof(tf <- "log.log", memory.profiling = TRUE)
# the code you want to profile must be in between
Rprof (NULL) ; print(summaryRprof(tf))
