在R中是否有衡量函数执行时间的标准化方法?
显然我可以用系统。时间，然后取它们的差异，但我想知道是否有一些标准化的方法或功能(不想发明轮子)。
我似乎记得我曾经用过如下的东西:
somesysfunction("myfunction(with,arguments)")
> Start time : 2001-01-01 00:00:00 # output of somesysfunction
> "Result" "of" "myfunction" # output of myfunction
> End time : 2001-01-01 00:00:10 # output of somesysfunction
> Total Execution time : 10 seconds # output of somesysfunction
当前回答
包“tictoc”为您提供了一种非常简单的测量执行时间的方法。文档在:https://cran.fhcrc.org/web/packages/tictoc/tictoc.pdf。
install.packages("tictoc")
require(tictoc)
tic()
rnorm(1000,0,1)
toc()
要保存经过的时间到一个变量，你可以这样做:
install.packages("tictoc")
require(tictoc)
tic()
rnorm(1000,0,1)
exectime <- toc()
exectime <- exectime$toc - exectime$tic
其他回答
另一种可能的方法是使用Sys.time():
start.time <- Sys.time()
...Relevent codes...
end.time <- Sys.time()
time.taken <- end.time - start.time
time.taken
与上面的答案相比，这不是最优雅的方法，但绝对是一种方法。
内置函数system.time()将执行此操作。
使用like: system。Time (result <- myfunction(with, arguments))
有几个答案提到取两个Sys.time()的差值。
start <- Sys.time()
## ... code here ... ##
end <- Sys.time()
end - start
这将以人类可读的格式打印结果，例如“2秒的时间差”。但是，由于单位可以变化(从“秒”到“分钟”到“天”)，因此，如果多个运行时的单位不同，那么使用此方法在相同基础上比较它们就不太有用。
对于非交互目的，最好指定时间单位。
具体来说，Sys.time()返回一个POSIXct对象。取两个posixct的差值，给出一个difftime类的对象，该对象具有“units”属性。特别是' - '操作被定义为在与POSIXct一起使用时使用difftime()。也就是说,
time2 - time1
等于
difftime(time2, time1)
要指定units属性，添加一个units=参数，例如。
difftime(time2, time1, units="secs")
总而言之，可以使用Sys.time()用指定的单位(秒、分等)来测量运行时。
start <- Sys.time()
## ... code here ... ##
end <- Sys.time()
difftime(end, start, units="secs")
编译以上所有的答案，我想到使用这些简化的tic toc函数
tic <- function(){ start.time <<- Sys.time() }
toc <- function(){ round(Sys.time() - start.time) }
用作:
tic()
Sys.sleep(3)
toc()
哪些印刷品:
时间差3秒
microbenchmark是一个轻量级(约50kB)包，或多或少是R中对多个表达式和函数进行基准测试的标准方法:
microbenchmark(myfunction(with,arguments))
例如:
> microbenchmark::microbenchmark(log10(5), log(5)/log(10), times = 10000)
Unit: nanoseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
log10(5) 0 0 25.5738 0 1 10265 10000 a
log(5)/log(10) 0 0 28.1838 0 1 10265 10000
在这里，两个表达式都被计算了10000次，平均执行时间约为25-30纳秒。
